PRKD1

PRKD1
Ідентифікатори
Символи	PRKD1, PKC-MU, PKCM, PKD, PRKCM, Protein kinase D1, CHDED
Зовнішні ІД	OMIM: 605435 MGI: 99879 HomoloGene: 55680 GeneCards: PRKD1
Пов'язані генетичні захворювання
	Congenital heart defects and ectodermal dysplasia
Реагує на сполуку
	sotrastaurin, gsk-690693
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • protein kinase C activity; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • ATP binding; • protein serine/threonine kinase activity;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • autophagosome membrane; • цитоплазма; • trans-Golgi network; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of endocytosis; • диференціація клітин; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • regulation of protein stability; • Golgi organization; • фосфорилювання; • процес імунної системи; • positive regulation of endothelial cell chemotaxis; • protein kinase D signaling; • sphingolipid biosynthetic process; • negative regulation of cell death; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of endothelial cell migration; • protein phosphorylation; • positive regulation of histone deacetylase activity; • positive regulation of CREB transcription factor activity; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • regulation of integrin-mediated signaling pathway; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • Ангіогенез; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of neuron projection development; • positive regulation of endothelial cell chemotaxis by VEGF-activated vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • integrin-mediated signaling pathway; • protein autophosphorylation; • cellular response to oxidative stress; • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; • Ras protein signal transduction; • проліферація; • inflammatory response; • вроджений імунітет; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз; • positive regulation of autophagy; • cellular response to amino acid starvation; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • cellular response to hydroperoxide; • regulation of keratinocyte proliferation; • positive regulation of osteoblast differentiation; • Golgi vesicle transport; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • peptidyl-threonine phosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5587
	18760
	ENSG00000184304
	ENSMUSG00000002688
	Q15139
	Q62101
	NM_002742; NM_001330069; NM_001348390
	NM_008858
	NP_001316998; NP_002733; NP_001335319
	NP_032884; NP_001369743; NP_001369744; NP_001369745
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRKD1 (англ. Protein kinase D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 912 амінокислот, а молекулярна маса — 101 704^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAPPVLRPP	SPLLPVAAAA	AAAAAALVPG	SGPGPAPFLA	PVAAPVGGIS
FHLQIGLSRE	PVLLLQDSSG	DYSLAHVREM	ACSIVDQKFP	ECGFYGMYDK
ILLFRHDPTS	ENILQLVKAA	SDIQEGDLIE	VVLSASATFE	DFQIRPHALF
VHSYRAPAFC	DHCGEMLWGL	VRQGLKCEGC	GLNYHKRCAF	KIPNNCSGVR
RRRLSNVSLT	GVSTIRTSSA	ELSTSAPDEP	LLQKSPSESF	IGREKRSNSQ
SYIGRPIHLD	KILMSKVKVP	HTFVIHSYTR	PTVCQYCKKL	LKGLFRQGLQ
CKDCRFNCHK	RCAPKVPNNC	LGEVTINGDL	LSPGAESDVV	MEEGSDDNDS
ERNSGLMDDM	EEAMVQDAEM	AMAECQNDSG	EMQDPDPDHE	DANRTISPST
SNNIPLMRVV	QSVKHTKRKS	STVMKEGWMV	HYTSKDTLRK	RHYWRLDSKC
ITLFQNDTGS	RYYKEIPLSE	ILSLEPVKTS	ALIPNGANPH	CFEITTANVV
YYVGENVVNP	SSPSPNNSVL	TSGVGADVAR	MWEIAIQHAL	MPVIPKGSSV
GTGTNLHRDI	SVSISVSNCQ	IQENVDISTV	YQIFPDEVLG	SGQFGIVYGG
KHRKTGRDVA	IKIIDKLRFP	TKQESQLRNE	VAILQNLHHP	GVVNLECMFE
TPERVFVVME	KLHGDMLEMI	LSSEKGRLPE	HITKFLITQI	LVALRHLHFK
NIVHCDLKPE	NVLLASADPF	PQVKLCDFGF	ARIIGEKSFR	RSVVGTPAYL
APEVLRNKGY	NRSLDMWSVG	VIIYVSLSGT	FPFNEDEDIH	DQIQNAAFMY
PPNPWKEISH	EAIDLINNLL	QVKMRKRYSV	DKTLSHPWLQ	DYQTWLDLRE
LECKIGERYI	THESDDLRWE	KYAGEQGLQY	PTHLINPSAS	HSDTPETEET
EMKALGERVS	IL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, ангіогенез, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література[ред. | ред. код]

Bagowski C.P., Stein-Gerlach M., Choidas A., Ullrich A. (1999). Cell-type specific phosphorylation of threonines T654 and T669 by PKD defines the signal capacity of the EGF receptor. EMBO J. 18: 5567—5576. PMID 10523301 DOI:10.1093/emboj/18.20.5567
Storz P., Toker A. (2003). Protein kinase D mediates a stress-induced NF-kappaB activation and survival pathway. EMBO J. 22: 109—120. PMID 12505989 DOI:10.1093/emboj/cdg009
Storz P., Doppler H., Johannes F.J., Toker A. (2003). Tyrosine phosphorylation of protein kinase D in the pleckstrin homology domain leads to activation. J. Biol. Chem. 278: 17969—17976. PMID 12637538 DOI:10.1074/jbc.M213224200
Storz P., Doppler H., Toker A. (2004). Protein kinase Cdelta selectively regulates protein kinase D-dependent activation of NF-kappaB in oxidative stress signaling. Mol. Cell. Biol. 24: 2614—2626. PMID 15024053 DOI:10.1128/MCB.24.7.2614-2626.2004
Eisenberg-Lerner A., Kimchi A. (2007). DAP kinase regulates JNK signaling by binding and activating protein kinase D under oxidative stress. Cell Death Differ. 14: 1908—1915. PMID 17703233 DOI:10.1038/sj.cdd.4402212
Doppler H., Storz P. (2007). A novel tyrosine phosphorylation site in protein kinase D contributes to oxidative stress-mediated activation. J. Biol. Chem. 282: 31873—31881. PMID 17804414 DOI:10.1074/jbc.M703584200

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRKD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Protein kinase D1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9407 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15139 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PRKD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Protein kinase D1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9407 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q15139 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

PRKD1

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук