SRPK2

SRPK2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2X7G
Ідентифікатори
Символи	SRPK2, SFRSK2, SRSF protein kinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602980 MGI: 1201408 HomoloGene: 101663 GeneCards: SRPK2
Пов'язані генетичні захворювання
	короткозорість
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • 14-3-3 protein binding; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • magnesium ion binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • ядерце; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • nuclear speck organization; • фосфорилювання; • mRNA processing; • regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein phosphorylation; • spliceosomal complex assembly; • positive regulation of neuron apoptotic process; • negative regulation of viral genome replication; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of cell cycle; • Ангіогенез; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of viral genome replication; • вроджений імунітет; • регуляція експресії генів; • regulation of mRNA processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6733
	20817
	ENSG00000135250
	ENSMUSG00000062604
	P78362
	O54781
NM_001278273; NM_182691; NM_182692; NM_001350738; NM_001350739;
	NM_001350740; NM_001350741; NM_001350742; NM_001350743; NM_001350744; NM_001350745; NM_001350746
NM_009274; NM_001359172; NM_001359173; NM_001359174; NM_001359175;
	NM_001359176
NP_001265202; NP_872633; NP_872634; NP_001337667; NP_001337668;
	NP_001337669; NP_001337670; NP_001337671; NP_001337672; NP_001337673; NP_001337674; NP_001337675
NP_033300; NP_001346101; NP_001346102; NP_001346103; NP_001346104;
	NP_001346105; NP_001394425; NP_001394427; NP_001394428; NP_001394429; NP_001394430; NP_001394431; NP_001394432; NP_001394433; NP_001394434; NP_001394435; NP_001394436; NP_001394437; NP_001394438; NP_001394439; NP_001394440; NP_001394441; NP_001394442; NP_001394443; NP_001394444; NP_001394445; NP_001394446; NP_001394447; NP_001394448; NP_001394449; NP_001394450; NP_001394451; NP_001394452
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SRPK2 (англ. SRSF protein kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 77 527^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVNSEKSSS	SERPEPQQKA	PLVPPPPPPP	PPPPPPLPDP	TPPEPEEEIL
GSDDEEQEDP	ADYCKGGYHP	VKIGDLFNGR	YHVIRKLGWG	HFSTVWLCWD
MQGKRFVAMK	VVKSAQHYTE	TALDEIKLLK	CVRESDPSDP	NKDMVVQLID
DFKISGMNGI	HVCMVFEVLG	HHLLKWIIKS	NYQGLPVRCV	KSIIRQVLQG
LDYLHSKCKI	IHTDIKPENI	LMCVDDAYVR	RMAAEATEWQ	KAGAPPPSGS
AVSTAPQQKP	IGKISKNKKK	KLKKKQKRQA	ELLEKRLQEI	EELEREAERK
IIEENITSAA	PSNDQDGEYC	PEVKLKTTGL	EEAAEAETAK	DNGEAEDQEE
KEDAEKENIE	KDEDDVDQEL	ANIDPTWIES	PKTNGHIENG	PFSLEQQLDD
EDDDEEDCPN	PEEYNLDEPN	AESDYTYSSS	YEQFNGELPN	GRHKIPESQF
PEFSTSLFSG	SLEPVACGSV	LSEGSPLTEQ	EESSPSHDRS	RTVSASSTGD
LPKAKTRAAD	LLVNPLDPRN	ADKIRVKIAD	LGNACWVHKH	FTEDIQTRQY
RSIEVLIGAG	YSTPADIWST	ACMAFELATG	DYLFEPHSGE	DYSRDEDHIA
HIIELLGSIP	RHFALSGKYS	REFFNRRGEL	RHITKLKPWS	LFDVLVEKYG
WPHEDAAQFT	DFLIPMLEMV	PEKRASAGEC	LRHPWLNS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zheng Y., Fu X.D., Ou J.H. (2005). Suppression of hepatitis B virus replication by SRPK1 and SRPK2 via a pathway independent of the phosphorylation of the viral core protein. Virology. 342: 150—158. PMID 16122776 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.030
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Giannakouros T., Nikolakaki E., Mylonis I., Georgatsou E. (2011). Serine-arginine protein kinases: a small protein kinase family with a large cellular presence. FEBS J. 278: 570—586. PMID 21205200 DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07987.x
Hong Y., Jang S.W., Ye K. (2011). The N-terminal fragment from caspase-cleaved serine/arginine protein-specific kinase2 (SRPK2) translocates into the nucleus and promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 777—786. PMID 21056976 DOI:10.1074/jbc.M110.193441