MMP7

MMP7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MMQ, 1MMR, 2MZE, 2DDY, 2Y6C, 2MZH, 1MMP, 2Y6D
Ідентифікатори
Символи	MMP7, MMP-7, MPSL1, PUMP-1, matrix metallopeptidase 7
Зовнішні ІД	OMIM: 178990 MGI: 103189 HomoloGene: 37619 GeneCards: MMP7
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metallopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • cell surface • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • maternal process involved in female pregnancy • еструс • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix disassembly • cellular response to mechanical stimulus • response to nutrient levels • collagen catabolic process • протеоліз • antibacterial peptide secretion • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4316	17393
Ensembl	ENSG00000137673	ENSMUSG00000018623
UniProt	P09237	Q10738 Q3UN27
RefSeq (мРНК)	NM_002423	NM_010810 NM_001319986
RefSeq (білок)	NP_002414	NP_001306915 NP_034940
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.52 – 102.53 Mb	Хр. 9: 7.69 – 7.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP7 (англ. Matrix metallopeptidase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 267 амінокислот, а молекулярна маса — 29 677.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLTVLCAVC		LLPGSLALPL		PQEAGGMSEL		QWEQAQDYLK		RFYLYDSETK
NANSLEAKLK		EMQKFFGLPI		TGMLNSRVIE		IMQKPRCGVP		DVAEYSLFPN
SPKWTSKVVT		YRIVSYTRDL		PHITVDRLVS		KALNMWGKEI		PLHFRKVVWG
TADIMIGFAR		GAHGDSYPFD		GPGNTLAHAF		APGTGLGGDA		HFDEDERWTD
GSSLGINFLY		AATHELGHSL		GMGHSSDPNA		VMYPTYGNGD		PQNFKLSQDD
IKGIQKLYGK		RSNSRKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Marti H.P., McNeil L., Thomas G., Davies M., Lovett D.H. (1992). Molecular characterization of a low-molecular-mass matrix metalloproteinase secreted by glomerular mesangial cells as PUMP-1. Biochem. J. 285: 899—905. PMID 1497627 DOI:10.1042/bj2850899
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Quantin B., Murphy G., Breathnach R. (1989). Pump-1 cDNA codes for a protein with characteristics similar to those of classical collagenase family members. Biochemistry. 28: 5327—5334. PMID 2550050 DOI:10.1021/bi00439a004
• Browner M.F., Smith W.W., Castelhano A.L. (1995). Matrilysin-inhibitor complexes: common themes among metalloproteases. Biochemistry. 34: 6602—6610. PMID 7756291 DOI:10.1021/bi00020a004
• Miyazaki K., Hattori Y., Umenishi F., Yasumitsu H., Umeda M. (1990). Purification and characterization of extracellular matrix-degrading metalloproteinase, matrin (pump-1), secreted from human rectal carcinoma cell line. Cancer Res. 50: 7758—7764. PMID 2253219

Див. також

• Хромосома 11