ADAMTS1

ADAMTS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JIH, 2V4B, 3Q2G, 3Q2H
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS1, C3-C5, METH1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605174 MGI: 109249 HomoloGene: 21381 GeneCards: ADAMTS1
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular region • базальна мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • ovulation from ovarian follicle • heart trabecula formation • розвиток нирки • протеоліз • integrin-mediated signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9510	11504
Ensembl	ENSG00000154734	ENSMUSG00000022893
UniProt	Q9UHI8	P97857
RefSeq (мРНК)	NM_006988	NM_009621
RefSeq (білок)	NP_008919	NP_033751
Локус (UCSC)	Хр. 21: 26.84 – 26.85 Mb	Хр. 16: 85.59 – 85.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS1 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 105 358.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRAVPEGFG		RRKLGSDMGN		AERAPGSRSF		GPVPTLLLLA		AALLAVSDAL
GRPSEEDEEL		VVPELERAPG		HGTTRLRLHA		FDQQLDLELR		PDSSFLAPGF
TLQNVGRKSG		SETPLPETDL		AHCFYSGTVN		GDPSSAAALS		LCEGVRGAFY
LLGEAYFIQP		LPAASERLAT		AAPGEKPPAP		LQFHLLRRNR		QGDVGGTCGV
VDDEPRPTGK		AETEDEDEGT		EGEDEGAQWS		PQDPALQGVG		QPTGTGSIRK
KRFVSSHRYV		ETMLVADQSM		AEFHGSGLKH		YLLTLFSVAA		RLYKHPSIRN
SVSLVVVKIL		VIHDEQKGPE		VTSNAALTLR		NFCNWQKQHN		PPSDRDAEHY
DTAILFTRQD		LCGSQTCDTL		GMADVGTVCD		PSRSCSVIED		DGLQAAFTTA
HELGHVFNMP		HDDAKQCASL		NGVNQDSHMM		ASMLSNLDHS		QPWSPCSAYM
ITSFLDNGHG		ECLMDKPQNP		IQLPGDLPGT		SYDANRQCQF		TFGEDSKHCP
DAASTCSTLW		CTGTSGGVLV		CQTKHFPWAD		GTSCGEGKWC		INGKCVNKTD
RKHFDTPFHG		SWGMWGPWGD		CSRTCGGGVQ		YTMRECDNPV		PKNGGKYCEG
KRVRYRSCNL		EDCPDNNGKT		FREEQCEAHN		EFSKASFGSG		PAVEWIPKYA
GVSPKDRCKL		ICQAKGIGYF		FVLQPKVVDG		TPCSPDSTSV		CVQGQCVKAG
CDRIIDSKKK		FDKCGVCGGN		GSTCKKISGS		VTSAKPGYHD		IITIPTGATN
IEVKQRNQRG		SRNNGSFLAI		KAADGTYILN		GDYTLSTLEQ		DIMYKGVVLR
YSGSSAALER		IRSFSPLKEP		LTIQVLTVGN		ALRPKIKYTY		FVKKKKESFN
AIPTFSAWVI		EEWGECSKSC		ELGWQRRLVE		CRDINGQPAS		ECAKEVKPAS
TRPCADHPCP		QWQLGEWSSC		SKTCGKGYKK		RSLKCLSHDG		GVLSHESCDP
LKKPKHFIDF		CTMAECS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Див. також

• Хромосома 21