23 вересня2016 в Будинку футболу відбулось жеребкування 1/8 фіналу розіграшу Кубка України сезону 2016/17. У ньому брали участь представники 10 команд-переможниць попередньої стадії (1/16) та 6 клубів Прем'єр-Ліги, які згідно з рейтингом станом на початок сезону посідали місця з 1-го по 6-е.
У 1/8 фіналу «Динамо» зустрілося із луганською«Зорею». Основний час матчу завершився унічию — 2:2. На початку матчу Дерліс Гонсалес скористався помилкою Сівакова в обороні і пройшовши на ударну позицію зіграв у стінку з Віктором Циганковим та відкрив рахунок у матчі. На 20 хвилині матчу Олександр Тимчик зіштовхнувся у карному майданчику з Бонавентуре, арбітр вказав на позначку і Рафаел Форстер упевнено зрівняв рахунок з пенальті розвівши м'яч та Рудька по різним кутам воріт. За 25 хвилин до кінця основного часу Жуніор Мораес віддав точну передачу на Віктора Циганкова, а той увірвавшись до штрафного майданчика поцілив у ближній кут — 2:1. А на останніх хвилинах другого тайму Михайло Сіваков знову зробив рахунок нічийним, замкнувши головою подачу Желько Любеновича. В екстра-таймі кияни розгромили гостей завдавши нищівної поразки 5:2. Спершу Дерліс Гонсалес оформив дубль, на 97-й хвилині точний пас Буяльського вивів парагвайця на «побачення» з Олексієм Шевченком і Дерліс не зміг не скористатися нагодою. А опісля той же ж Буяльський вже вивів Мораеса віч-на-віч з голкіпером «Зорі», але останній сфолив при відборі м'яча й бразилець холоднокровно реалізував 11-метровий. На 119-й хвилині вже Сіваков у карному майданчику сфолив на Мораесі та бразильський форвард вдруге забив з «точки».
Матч 1/4 фіналу проти охтирського«Нафтовика-Укрнафти» переносили через незадовільний стан поля і врешті-решт матч був зіграний 5 квітня2017 р. поєдинок виявився на диво нерезультативним і єдиний гол у матчі забив Денис Гармаш на 44-й хвилині, головою замкнувши подачу Миколи Морозюка. Як підсумок — гостьова перемога «Динамо» 1:0.
Півфінальний матч київське «Динамо» грало проти першолігового«Миколаєва». Поєдинок виявився цікавим — моментів вистачало, як у однієї команди, так і у іншої. Рахунок був відкритий лише на першій компенсованій хвилині до першого тайму і не в останню чергу завдяки діям кіпера «Миколаєва» Романа Чумака. Антунеш із флангу подав до штрафного майданчику де м'яч знайшла голова Романа Яремчука, та тому не вистачило простору аби розвернутися і вин скинув на набігаючого Ярмоленка, а вже капітан «Динамо» направив «круглого» у сітку воріт господарів. Наступного голу прийшлося чекати аж до 62-ї хвилини. Після невдалої подачі від кутового прапорця Миколи Морозюка м'яч відскочив до Тамаша Кадара, а угорськийзахисник ударом ножицями через себе поцілив у дальній кут — 2:0. За 10 хвилин до завершення основного часу Віталій Павлов сфолив на Ярмоленку у карному майданчику і Катерина Монзуль назначила 11-метровий удар, який упевнено виконав пострадалий. А на останніх компенсованих хвилинах матчу Морозюк віддав точну передачу на капітана киян і той в дотик відправив м'яч у сітку воріт і оформив хет-трик. Таким чином «Динамо» розгромило МФК «Миколаїв» у його рідних стінах — 4:0.
У Лізі чемпіонів 2016–2017 беруть участь 78 команд з 53 асоціацій, що входять до УЄФА. Згідно рейтингу у таблиці коефіцієнтів УЄФА Асоціація «Україна», яка зайняла 8-ме місце, представлена двома командами — чемпіоном та срібним призером. При квотах враховуються здобутки в єврокубках з 2010—2011 до 2014—2015 років[13][14].
Враховуючи, що команда ФК «Динамо» (Київ) у минулому сезоні стала чемпіоном Прем'єр-ліги, то команда розпочинає змагання з групового етапу, як один з 12-ти чемпіонів футбольних асоціацій #1 — #12 у рейтингу.
Жеребкування групового етапу відбулось в Монако25 серпня2016 року. Команда ФК «Динамо» (Київ) з рейтингом 65,976 попала у третій кошик[15].
Переможець групи та команда, що посіла друге місце у групі проходять у наступний раунд (Плей-Оф). Команда, яка займе 3-тє місце попадає в 1/16 Ліги Європи УЄФА[16][17].
У підсумку команда зайняла 4-те, останнє місце у групі та покинула єврокубки.
Молодіжна команда «Динамо» грає у Молодіжному чемпіонаті України і дозволяє отримати ігрову практику футболістам, які не проходять в основу своєї команди, а також відновлюються після травм, тому на полі одночасно можуть знаходитись не більше 4 футболістів, що старші 1996 року.
Юнацька (U-19) команда «Динамо» грає у Чемпіонат U-19 України і дозволяє ігрову практику футболістам, які випустилися з футбольної школи команди, але ще не мають достатньої практики для виступів у молодіжному чемпіонаті, тому на полі можуть знаходитись лише футболісти від 1997 року і молодше.