COL6A5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
COL6A5
Ідентифікатори
Символи COL6A5, collagen, type VI, alpha 5, COL29A1, VWA4, collagen type VI alpha 5, collagen type VI alpha 5 chain
Зовнішні ІД OMIM: 611916 MGI: 3648134 HomoloGene: 122792 GeneCards: COL6A5
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001278298
NM_153264
NM_001167923
RefSeq (білок)
NP_001265227
NP_694996
NP_001161395
Локус (UCSC) Хр. 3: 130.35 – 130.48 Mb Хр. 9: 105.73 – 105.84 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL6A5 (англ. Collagen type VI alpha 5 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 615 амінокислот, а молекулярна маса — 289 926[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKILLIIFVLIIWTETLADQSPGPGPVYADVVFLVDSSDHLGPKSFPFVK
TFINKMINSLPIEANKYRVALAQYSDEFHSEFHLSTFKGRSPMLNHLKKN
FQFIGGSLQIGKALQEAHRTYFSAPINGRDRKQFPPILVVLASAESEDEV
EEASKALQKDGVKIISVGVQKASEENLKAMATSHFHFNLRTIRDLSTFSQ
NMTQIIKDVTKYKEGAVDADMQVHFPISCQKDSLADLVFLVDESLGTGGN
LRHLQTFLENITSSMDVKENCMRLGLMSYSNSAKTISFLKSSTTQSEFQQ
QIKNLSIQVGKSNTGAAIDQMRRDGFSESYGSRRAQGVPQIAVLVTHRPS
DDEVHDAALNLRLEDVNVFALSIQGANNTQLEEIVSYPPEQTISTLKSYA
DLETYSTKFLKKLQNEIWSQISTYAEQRNLDKTGCVDTKEADIHFLIDGS
SSIQEKQFEQIKRFMLEVTEMFSIGPDKVRVGVVQYSDDTEVEFYITDYS
NDIDLRKAIFNIKQLTGGTYTGKALDYILQIIKNGMKDRMSKVPCYLIVL
TDGMSTDRVVEPAKRLRAEQITVHAVGIGAANKIELQEIAGKEERVSFGQ
NFDALKSIKNEVVREICAEKGCEDMKADIMFLVDSSWSIGNENFRKMKIF
MKNLLTKIQIGADKTQIGVVQFSDKTKEEFQLNRYFTQQEISDAIDRMSL
INEGTLTGKALNFVGQYFTHSKGARLGAKKFLILITDGVAQDDVRDPARI
LRGKDVTIFSVGVYNANRSQLEEISGDSSLVFHVENFDHLKALERKLIFR
VCALHDCKRITLLDVVFVLDHSGSIKKQYQDHMINLTIHLVKKADVGRDR
VQFGALKYSDQPNILFYLNTYSNRSAIIENLRKRRDTGGNTYTAKALKHA
NALFTEEHGSRIKQNVKQMLIVITDGESHDHDQLNDTALELRNKGITIFA
VGVGKANQKELEGMAGNKNNTIYVDNFDKLKDVFTLVQERMCTEAPEVCH
LQEADVIFLCDGSDRVSNSDFVTMTTFLSDLIDNFDIQSQRMKIGMAQFG
SNYQSIIELKNSLTKTQWKTQIQNVSKSGGFPRIDFALKKVSNMFNLHAG
GRRNAGVPQTLVVITSGDPRYDVADAVKTLKDLGICVLVLGIGDVYKEHL
LPITGNSEKIITFQDFDKLKNVDVKKRIIREICQSCGKTNCFMDIVVGFD
ISTHVQGQPLFQGHPQLESYLPGILEDISSIKGVSCGAGTEAQVSLAFKV
NSDQGFPAKFQIYQKAVFDSLLQVNVSGPTHLNAQFLRSLWDTFKDKSAS
RGQVLLIFSDGLQSESNIMLENQSDRLREAGLDALLVVSLNTTAHHEFSS
FEFGKRFDYRTHLTIGMRELGKKLSQYLGNIAERTCCCTFCKCPGIPGPH
GTRGLQAMKGSQGLKGSRGHRGEDGNPGVRGDTGPQGDKGIAGCPGAWGQ
KGLKGFSGPKGGHGDDGIDGLDGEEGCHGFPGIKGEKGDPGSQGSPGSRG
APGQYGEKGFPGDPGNPGQNNNIKGQKGSKGEQGRQGRSGQKGVQGSPSS
RGSRGREGQRGLRGVSGEPGNPGPTGTLGAEGLQGPQGSQGNPGRKGEKG
SQGQKGPQGSPGLMGAKGSTGRPGLLGKKGEPGLPGDLGPVGQTGQRGRQ
GDSGIPGYGQMGRKGVKGPRGFPGDAGQKGDIGNPGIPGGPGPKGFRGLA
LTVGLKGEEGSRGLPGPPGQRGIKGMAGQPVYSQCDLIRFLREHSPCWKE
KCPAYPTELVFALDNSYDVTEESFNKTRDIITSIVNDLNIRENNCPVGAR
VAMVSYNSGTSYLIRWSDYNRKKQLLQQLSQIKYQDTTEPRDVGNAMRFV
TRNVFKRTYAGANVRRVAVFFSNGQTASRSSIITATMEFSALDISPTVFA
FDERVFLEAFGFDNTGTFQVIPVPPNGENQTLERLRRCALCYDKCFPNAC
IREAFLPEDSYMDVVFLIDNSRNIAKDEFKAVKALVSSVIDNFNIASDPL
ISDSGDRIALLSYSPWESSRRKMGTVKTEFDFITYDNQLLMKNHIQTSFQ
QLNGEATIGRALLWTTENLFPETPYLRKHKVIFVVSAGENYERKEFVKMM
ALRAKCQGYVIFVISLGSTRKDDMEELASYPLDQHLIQLGRIHKPDLNYI
AKFLKPFLYSVRRGFNQYPPPMLEDACRLINLGGENIQNDGFQFVTELQE
DFLGGNGFIGQELNSGRESPFVKTEDNGSDYLVYLPSQMFEPQKLMINYE
KDQKSAEIASLTSGHENYGRKEEPDHTYEPGDVSLQEYYMDVAFLIDASQ
RVGSDEFKEVKAFITSVLDYFHIAPTPLTSTLGDRVAVLSYSPPGYMPNT
EECPVYLEFDLVTYNSIHQMKHHLQDSQQLNGDVFIGHALQWTIDNVFVG
TPNLRKNKVIFVISAGETNSLDKDVLRNVSLRAKCQGYSIFVFSFGPKHN
DKELEELASHPLDHHLVQLGRTHKPDWNYIIKFVKPFVHLIRRAINKYPT
EDMKATCVNMTSPNPENGGTENTVLLLPGIYEIKTENGDLFDEFDSQAQH
LLVLGNNHSSGSETATDLMQKLYLLFSTEKLAMKDKEKAHLEEISALVVD
KQQEKEDKEMEATDI

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26674 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, A8TX70 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]