LAMA5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
LAMA5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LAMA5, Laminin, alpha 5, laminin subunit alpha 5
Зовнішні ІД OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 GeneCards: LAMA5
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005560
NM_001081171
RefSeq (білок)
NP_005551
NP_001074640
Локус (UCSC) Хр. 20: 62.31 – 62.37 Mb Хр. 2: 179.82 – 179.87 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LAMA5 (англ. Laminin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 695 амінокислот, а молекулярна маса — 399 737[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYF
NLAEGARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRG
QYCDICTAANSNKAHPASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQ
VFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFG
PQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLL
REFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISIGGRC
VCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATA
NSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHT
TGVNCERCLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCR
PNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAG
TQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVAD
DRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCD
EAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLC
RCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRP
RVTGLRCDTCVPGAYNFPYCEAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHV
EGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGCTRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCK
PHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDIGGALGQSCEPRTGVCRC
RPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAVRFGFNPLEFEN
FSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVRE
EGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRV
EAEGVLLDYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHL
PLDGFPSAAGLEALCRQDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQ
VAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTL
CRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFV
EPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTH
AQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYA
FLLHGYQPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQA
LLDVTHSELTVTVRVPKGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDF
ISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTC
EPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARLCDELTGQCIC
PPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQC
KCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKE
NVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDM
EGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSY
LGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGNQMSITFLEPA
YPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFS
QISSAVFLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFY
RDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFV
SSRDDPSAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCER
CAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTG
PRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHCLCKAGVTGRR
CDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCR
ECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ
VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSM
AWARLHRLNASIADLQSQLRSPLGPRHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRL
GGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLG
LANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLA
RVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDATREAQE
LNSRNQERLEEALQRKQELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHSLDQA
KEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLAL
NLSSIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTW
ATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDV
RAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQL
QAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVSTLEKTLPQLLAKLSIL
ENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSGVQLRTP
RDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLR
DKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGEQFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQM
IQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCI
EMDTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTG
FARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVL
LYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRVERATVYS
VEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIKALGKY
VDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSG
FGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTEVKTQAGFADGA
PHYVAFYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLP
ESGTIYNFSGCISNVFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTGCAPALQAQT
PGLGPRGLQATARKASRRSRQPARHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSH
LEFVGILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGH
FVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQE
GPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCVKRLRLHGRP
LGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVR
PLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVTEKQVLLRADDGAGEFSTSVTRPSVL
CDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPE
PMAVQPWPPAYCGCMRRLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]