COL8A2

COL8A2
Ідентифікатори
Символи	COL8A2, FECD, FECD1, PPCD, PPCD2, collagen type VIII alpha 2, collagen type VIII alpha 2 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120252 MGI: 88464 HomoloGene: 55879 GeneCards: COL8A2
Пов'язані генетичні захворювання
Fuchs' endothelial dystrophy
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • Базальна мембрана • Колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • collagen catabolic process • extracellular matrix organization • epithelial cell proliferation • адгезія клітин • camera-type eye morphogenesis • Ангіогенез • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1296	329941
Ensembl	ENSG00000171812	ENSMUSG00000056174
UniProt	P25067 Q4VAQ0	P25318
RefSeq (мРНК)	NM_001294347 NM_005202	NM_199473
RefSeq (білок)	NP_001281276 NP_005193	NP_955767
Локус (UCSC)	Хр. 1: 36.1 – 36.13 Mb	Хр. 4: 126.18 – 126.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL8A2 (англ. Collagen type VIII alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 67 244.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGTLTPLSS		LLLLLLVLVL		GCGPRASSGG		GAGGAAGYAP		VKYIQPMQKG
PVGPPFREGK		GQYLEMPLPL		LPMDLKGEPG		PPGKPGPRGP		PGPPGFPGKP
GMGKPGLHGQ		PGPAGPPGFS		RMGKAGPPGL		PGKVGPPGQP		GLRGEPGIRG
DQGLRGPPGP		PGLPGPSGIT		IPGKPGAQGV		PGPPGFQGEP		GPQGEPGPPG
DRGLKGDNGV		GQPGLPGAPG		QGGAPGPPGL		PGPAGLGKPG		LDGLPGAPGD
KGESGPPGVP		GPRGEPGAVG		PKGPPGVDGV		GVPGAAGLPG		PQGPSGAKGE
PGTRGPPGLI		GPTGYGMPGL		PGPKGDRGPA		GVPGLLGDRG		EPGEDGEPGE
QGPQGLGGPP		GLPGSAGLPG		RRGPPGPKGE		AGPGGPPGVP		GIRGDQGPSG
LAGKPGVPGE		RGLPGAHGPP		GPTGPKGEPG		FTGRPGGPGV		AGALGQKGDL
GLPGQPGLRG		PSGIPGLQGP		AGPIGPQGLP		GLKGEPGLPG		PPGEGRAGEP
GTAGPTGPPG		VPGSPGITGP		PGPPGPPGPP		GAPGAFDETG		IAGLHLPNGG
VEGAVLGKGG		KPQFGLGELS		AHATPAFTAV		LTSPFPASGM		PVKFDRTLYN
GHSGYNPATG		IFTCPVGGVY		YFAYHVHVKG		TNVWVALYKN		NVPATYTYDE
YKKGYLDQAS		GGAVLQLRPN		DQVWVQMPSD		QANGLYSTEY		IHSSFSGFLL
CPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, ангіогенез, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Kittelberger R., Neale T.J., Francky K.T., Greenhill N.S., Gibson G.J. (1992). Cleavage of type VIII collagen by human neutrophil elastase. Biochim. Biophys. Acta. 1139: 295—299. PMID 1515454 DOI:10.1016/0925-4439(92)90103-T
• Greenhill N.S., Ruger B.M., Hasan Q., Davis P.F. (2000). The alpha1(VIII) and alpha2(VIII) collagen chains form two distinct homotrimeric proteins in vivo. Matrix Biol. 19: 19—28. PMID 10686422 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00053-0
• Stephan S., Sherratt M.J., Hodson N., Shuttleworth C.A., Kielty C.M. (2004). Expression and supramolecular assembly of recombinant alpha1(viii) and alpha2(viii) collagen homotrimers. J. Biol. Chem. 279: 21469—21477. PMID 14990571 DOI:10.1074/jbc.M305805200

Див. також

• Хромосома 1