COL16A1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
COL16A1
Ідентифікатори
Символи COL16A1, 447AA, FP1572, collagen type XVI alpha 1, collagen type XVI alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 120326 MGI: 1095396 HomoloGene: 1397 GeneCards: COL16A1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001856
NM_028266
RefSeq (білок)
NP_001847
NP_082542
NP_001391281
NP_001391282
Локус (UCSC) Хр. 1: 31.65 – 31.7 Mb Хр. 4: 129.94 – 129.99 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL16A1 (англ. Collagen type XVI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 604 амінокислот, а молекулярна маса — 157 751[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MWVSWAPGLWLLGLWATFGHGANTGAQCPPSQQEGLKLEHSSSLPANVTG
FNLIHRLSLMKTSAIKKIRNPKGPLILRLGAAPVTQPTRRVFPRGLPEEF
ALVLTLLLKKHTHQKTWYLFQVTDANGYPQISLEVNSQERSLELRAQGQD
GDFVSCIFPVPQLFDLRWHKLMLSVAGRVASVHVDCSSASSQPLGPRRPM
RPVGHVFLGLDAEQGKPVSFDLQQVHIYCDPELVLEEGCCEILPAGCPPE
TSKARRDTQSNELIEINPQSEGKVYTRCFCLEEPQNSEVDAQLTGRISQK
AERGAKVHQETAADECPPCVHGARDSNVTLAPSGPKGGKGERGLPGPPGS
KGEKGARGNDCVRISPDAPLQCAEGPKGEKGESGALGPSGLPGSTGEKGQ
KGEKGDGGIKGVPGKPGRDGRPGEICVIGPKGQKGDPGFVGPEGLAGEPG
PPGLPGPPGIGLPGTPGDPGGPPGPKGDKGSSGIPGKEGPGGKPGKPGVK
GEKGDPCEVCPTLPEGFQNFVGLPGKPGPKGEPGDPVPARGDPGIQGIKG
EKGEPCLSCSSVVGAQHLVSSTGASGDVGSPGFGLPGLPGRAGVPGLKGE
KGNFGEAGPAGSPGPPGPVGPAGIKGAKGEPCEPCPALSNLQDGDVRVVA
LPGPSGEKGEPGPPGFGLPGKQGKAGERGLKGQKGDAGNPGDPGTPGTTG
RPGLSGEPGVQGPAGPKGEKGDGCTACPSLQGTVTDMAGRPGQPGPKGEQ
GPEGVGRPGKPGQPGLPGVQGPPGLKGVQGEPGPPGRGVQGPQGEPGAPG
LPGIQGLPGPRGPPGPTGEKGAQGSPGVKGATGPVGPPGASVSGPPGRDG
QQGQTGLRGTPGEKGPRGEKGEPGECSCPSQGDLIFSGMPGAPGLWMGSS
WQPGPQGPPGIPGPPGPPGVPGLQGVPGNNGLPGQPGLTAELGSLPIEQH
LLKSICGDCVQGQRAHPGYLVEKGEKGDQGIPGVPGLDNCAQCFLSLERP
RAEEARGDNSEGDPGCVGSPGLPGPPGLPGQRGEEGPPGMRGSPGPPGPI
GPPGFPGAVGSPGLPGLQGERGLTGLTGDKGEPGPPGQPGYPGATGPPGL
PGIKGERGYTGSAGEKGEPGPPGSEGLPGPPGPAGPRGERGPQGNSGEKG
DQGFQGQPGFPGPPGPPGFPGKVGSPGPPGPQAEKGSEGIRGPSGLPGSP
GPPGPPGIQGPAGLDGLDGKDGKPGLRGDPGPAGPPGLMGPPGFKGKTGH
PGLPGPKGDCGKPGPPGSTGRPGAEGEPGAMGPQGRPGPPGHVGPPGPPG
QPGPAGISAVGLKGDRGATGERGLAGLPGQPGPPGHPGPPGEPGTDGAAG
KEGPPGKQGFYGPPGPKGDPGAAGQKGQAGEKGRAGMPGGPGKSGSMGPV
GPPGPAGERGHPGAPGPSGSPGLPGVPGSMGDMVNYDEIKRFIRQEIIKM
FDERMAYYTSRMQFPMEMAAAPGRPGPPGKDGAPGRPGAPGSPGLPGQIG
REGRQGLPGVRGLPGTKGEKGDIGIGIAGENGLPGPPGPQGPPGYGKMGA
TGPMGQQGIPGIPGPPGPMGQPGKAGHCNPSDCFGAMPMEQQYPPMKTMK
GPFG

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Pan T.-C., Zhang R.-Z., Mattei M.-G., Timpl R., Chu M.-L. (1992). Cloning and chromosomal location of human alpha 1(XVI) collagen. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 6565—6569. PMID 1631157 DOI:10.1073/pnas.89.14.6565
  • Grassel S., Timpl R., Tan E.M.L., Chu M.-L. (1996). Biosynthesis and processing of type XVI collagen in human fibroblasts and smooth muscle cells. Eur. J. Biochem. 242: 576—584. PMID 9022684 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0576r.x

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2193 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, Q07092 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]