COL1A1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук
COL1A1
COL1A1 protein - PDB rendering based on 1y0f.jpg
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL1A1, EDSC, OI1, OI2, OI3, OI4, collagen type I alpha 1, collagen type I alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 120150 MGI: 88467 HomoloGene: 73874 GeneCards: COL1A1
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози[1]
Шаблон експресії
PBB GE COL1A1 202310 s at fs.png

PBB GE COL1A1 202311 s at fs.png

PBB GE COL1A1 202312 s at fs.png
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_000088
NM_007742
RefSeq (білок)
NP_000079
NP_031768
Локус (UCSC) Хр. 17: 50.18 – 50.2 Mb Хр. 11: 94.94 – 94.95 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL1A1 (англ. Collagen type I alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 464 амінокислот, а молекулярна маса — 138 941[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MFSFVDLRLL LLLAATALLT HGQEEGQVEG QDEDIPPITC VQNGLRYHDR
DVWKPEPCRI CVCDNGKVLC DDVICDETKN CPGAEVPEGE CCPVCPDGSE
SPTDQETTGV EGPKGDTGPR GPRGPAGPPG RDGIPGQPGL PGPPGPPGPP
GPPGLGGNFA PQLSYGYDEK STGGISVPGP MGPSGPRGLP GPPGAPGPQG
FQGPPGEPGE PGASGPMGPR GPPGPPGKNG DDGEAGKPGR PGERGPPGPQ
GARGLPGTAG LPGMKGHRGF SGLDGAKGDA GPAGPKGEPG SPGENGAPGQ
MGPRGLPGER GRPGAPGPAG ARGNDGATGA AGPPGPTGPA GPPGFPGAVG
AKGEAGPQGP RGSEGPQGVR GEPGPPGPAG AAGPAGNPGA DGQPGAKGAN
GAPGIAGAPG FPGARGPSGP QGPGGPPGPK GNSGEPGAPG SKGDTGAKGE
PGPVGVQGPP GPAGEEGKRG ARGEPGPTGL PGPPGERGGP GSRGFPGADG
VAGPKGPAGE RGSPGPAGPK GSPGEAGRPG EAGLPGAKGL TGSPGSPGPD
GKTGPPGPAG QDGRPGPPGP PGARGQAGVM GFPGPKGAAG EPGKAGERGV
PGPPGAVGPA GKDGEAGAQG PPGPAGPAGE RGEQGPAGSP GFQGLPGPAG
PPGEAGKPGE QGVPGDLGAP GPSGARGERG FPGERGVQGP PGPAGPRGAN
GAPGNDGAKG DAGAPGAPGS QGAPGLQGMP GERGAAGLPG PKGDRGDAGP
KGADGSPGKD GVRGLTGPIG PPGPAGAPGD KGESGPSGPA GPTGARGAPG
DRGEPGPPGP AGFAGPPGAD GQPGAKGEPG DAGAKGDAGP PGPAGPAGPP
GPIGNVGAPG AKGARGSAGP PGATGFPGAA GRVGPPGPSG NAGPPGPPGP
AGKEGGKGPR GETGPAGRPG EVGPPGPPGP AGEKGSPGAD GPAGAPGTPG
PQGIAGQRGV VGLPGQRGER GFPGLPGPSG EPGKQGPSGA SGERGPPGPM
GPPGLAGPPG ESGREGAPGA EGSPGRDGSP GAKGDRGETG PAGPPGAPGA
PGAPGPVGPA GKSGDRGETG PAGPTGPVGP VGARGPAGPQ GPRGDKGETG
EQGDRGIKGH RGFSGLQGPP GPPGSPGEQG PSGASGPAGP RGPPGSAGAP
GKDGLNGLPG PIGPPGPRGR TGDAGPVGPP GPPGPPGPPG PPSAGFDFSF
LPQPPQEKAH DGGRYYRADD ANVVRDRDLE VDTTLKSLSQ QIENIRSPEG
SRKNPARTCR DLKMCHSDWK SGEYWIDPNQ GCNLDAIKVF CNMETGETCV
YPTQPSVAQK NWYISKNPKD KRHVWFGESM TDGFQFEYGG QGSDPADVAI
QLTFLRLMST EASQNITYHC KNSVAYMDQQ TGNLKKALLL QGSNEIEIRA
EGNSRFTYSV TVDGCTSHTG AWGKTVIEYK TTKTSRLPII DVAPLDVGAP
DQEFGFDVGP VCFL

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література[ред.ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14. 2004. с. 2121 — 2127.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bornstein P., McKay J., Morishima J.K., Devarayalu S., Gelinas R.E. (1987). Regulatory elements in the first intron contribute to transcriptional control of the human alpha 1(I) collagen gene.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84. с. 8869 — 8873.  PubMed DOI:10.1073/pnas.84.24.8869
  • Click E.M., Bornstein P. (1970). Isolation and characterization of the cyanogen bromide peptides from the alpha 1 and alpha 2 chains of human skin collagen.. Biochemistry 9. с. 4699 — 4706.  PubMed DOI:10.1021/bi00826a012
  • Chu M.-L., Myers J.C., Bernard M.P., Ding J.-F., Ramirez F. (1982). Cloning and characterization of five overlapping cDNAs specific for the human pro alpha 1(I) collagen chain.. Nucleic Acids Res. 10. с. 5925 — 5934.  PubMed DOI:10.1093/nar/10.19.5925
  • Barsh G.S., Roush C.L., Bonadio J., Byers P.H., Gelinas R.E. (1985). Intron-mediated recombination may cause a deletion in an alpha 1 type I collagen chain in a lethal form of osteogenesis imperfecta.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82. с. 2870 — 2874.  PubMed DOI:10.1073/pnas.82.9.2870
  • Maekelae J.K., Raassina M., Virta A., Vuorio E. (1988). Human pro alpha 1(I) collagen: cDNA sequence for the C-propeptide domain.. Nucleic Acids Res. 16. с. 349 — 349.  PubMed DOI:10.1093/nar/16.1.349

Примітки[ред.ред. код]

Див. також[ред.ред. код]

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.