COL4A3

COL4A3
Ідентифікатори
Символи	COL4A3, collagen type IV alpha 3 chain, ATS2, ATS3
Зовнішні ІД	OMIM: 120070 MGI: 104688 HomoloGene: 68033 GeneCards: COL4A3
Реагує на сполуку
ocriplasmin
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase inhibitor activity • integrin binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • колаген • endoplasmic reticulum lumen • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум • extracellular region • базальна мембрана • collagen type IV trimer • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • extracellular matrix organization • слух • кровообіг • адгезія клітин • endothelial cell apoptotic process • проліферація • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of endopeptidase activity • negative regulation of angiogenesis • glomerular basement membrane development • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • response to glucose Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1285	12828
Ensembl	ENSG00000169031	ENSMUSG00000079465
UniProt	Q01955	Q9QZS0
RefSeq (мРНК)	NM_000091 NM_031362 NM_031363 NM_031364 NM_031365 NM_031366	NM_007734
RefSeq (білок)	NP_000082	NP_031760
Локус (UCSC)	Хр. 2: 227.16 – 227.31 Mb	Хр. 1: 82.56 – 82.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL4A3 (англ. Collagen type IV alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 161 813.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSARTAPRPQ		VLLLPLLLVL		LAAAPAASKG		CVCKDKGQCF		CDGAKGEKGE
KGFPGPPGSP		GQKGFTGPEG		LPGPQGPKGF		PGLPGLTGSK		GVRGISGLPG
FSGSPGLPGT		PGNTGPYGLV		GVPGCSGSKG		EQGFPGLPGT		LGYPGIPGAA
GLKGQKGAPA		KEEDIELDAK		GDPGLPGAPG		PQGLPGPPGF		PGPVGPPGPP
GFFGFPGAMG		PRGPKGHMGE		RVIGHKGERG		VKGLTGPPGP		PGTVIVTLTG
PDNRTDLKGE		KGDKGAMGEP		GPPGPSGLPG		ESYGSEKGAP		GDPGLQGKPG
KDGVPGFPGS		EGVKGNRGFP		GLMGEDGIKG		QKGDIGPPGF		RGPTEYYDTY
QEKGDEGTPG		PPGPRGARGP		QGPSGPPGVP		GSPGSSRPGL		RGAPGWPGLK
GSKGERGRPG		KDAMGTPGSP		GCAGSPGLPG		SPGPPGPPGD		IVFRKGPPGD
HGLPGYLGSP		GIPGVDGPKG		EPGLLCTQCP		YIPGPPGLPG		LPGLHGVKGI
PGRQGAAGLK		GSPGSPGNTG		LPGFPGFPGA		QGDPGLKGEK		GETLQPEGQV
GVPGDPGLRG		QPGRKGLDGI		PGTPGVKGLP		GPKGELALSG		EKGDQGPPGD
PGSPGSPGPA		GPAGPPGYGP		QGEPGLQGTQ		GVPGAPGPPG		EAGPRGELSV
STPVPGPPGP		PGPPGHPGPQ		GPPGIPGSLG		KCGDPGLPGP		DGEPGIPGIG
FPGPPGPKGD		QGFPGTKGSL		GCPGKMGEPG		LPGKPGLPGA		KGEPAVAMPG
GPGTPGFPGE		RGNSGEHGEI		GLPGLPGLPG		TPGNEGLDGP		RGDPGQPGPP
GEQGPPGRCI		EGPRGAQGLP		GLNGLKGQQG		RRGKTGPKGD		PGIPGLDRSG
FPGETGSPGI		PGHQGEMGPL		GQRGYPGNPG		ILGPPGEDGV		IGMMGFPGAI
GPPGPPGNPG		TPGQRGSPGI		PGVKGQRGTP		GAKGEQGDKG		NPGPSEISHV
IGDKGEPGLK		GFAGNPGEKG		NRGVPGMPGL		KGLKGLPGPA		GPPGPRGDLG
STGNPGEPGL		RGIPGSMGNM		GMPGSKGKRG		TLGFPGRAGR		PGLPGIHGLQ
GDKGEPGYSE		GTRPGPPGPT		GDPGLPGDMG		KKGEMGQPGP		PGHLGPAGPE
GAPGSPGSPG		LPGKPGPHGD		LGFKGIKGLL		GPPGIRGPPG		LPGFPGSPGP
MGIRGDQGRD		GIPGPAGEKG		ETGLLRAPPG		PRGNPGAQGA		KGDRGAPGFP
GLPGRKGAMG		DAGPRGPTGI		EGFPGPPGLP		GAIIPGQTGN		RGPPGSRGSP
GAPGPPGPPG		SHVIGIKGDK		GSMGHPGPKG		PPGTAGDMGP		PGRLGAPGTP
GLPGPRGDPG		FQGFPGVKGE		KGNPGFLGSI		GPPGPIGPKG		PPGVRGDPGT
LKIISLPGSP		GPPGTPGEPG		MQGEPGPPGP		PGNLGPCGPR		GKPGKDGKPG
TPGPAGEKGN		KGSKGEPGPA		GSDGLPGLKG		KRGDSGSPAT		WTTRGFVFTR
HSQTTAIPSC		PEGTVPLYSG		FSFLFVQGNQ		RAHGQDLGTL		GSCLQRFTTM
PFLFCNVNDV		CNFASRNDYS		YWLSTPALMP		MNMAPITGRA		LEPYISRCTV
CEGPAIAIAV		HSQTTDIPPC		PHGWISLWKG		FSFIMFTSAG		SEGTGQALAS
PGSCLEEFRA		SPFLECHGRG		TCNYYSNSYS		FWLASLNPER		MFRKPIPSTV
KAGELEKIIS		RCQVCMKKRH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Raya A., Revert F., Navarro S., Saus J. (1999). Characterization of a novel type of serine/threonine kinase that specifically phosphorylates the human goodpasture antigen. J. Biol. Chem. 274: 12642—12649. PMID 10212244 DOI:10.1074/jbc.274.18.12642
• Maeshima Y., Colorado P.C., Kalluri R. (2000). Two RGD-independent alpha vbeta 3 integrin binding sites on tumstatin regulate distinct anti-tumor properties. J. Biol. Chem. 275: 23745—23750. PMID 10837460 DOI:10.1074/jbc.C000186200
• Nagel M., Nagorka S., Gross O. (2005). Novel COL4A5, COL4A4, and COL4A3 mutations in Alport syndrome. Hum. Mutat. 26: 60—60. PMID 15954103 DOI:10.1002/humu.9349
• Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 23013—23017. PMID 8083201
• Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1992). Exon/intron structure of the human alpha 3(IV) gene encompassing the Goodpasture antigen (alpha 3(IV)NC1). Identification of a potentially antigenic region at the triple helix/NC1 domain junction. J. Biol. Chem. 267: 19780—19784. PMID 1400291
• Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1994). J. Biol. Chem. 269: 17358—17358. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8006044

Див. також

• Хромосома 2