COL2A1
COL2A1 (англ. Collagen type II alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 487 амінокислот, а молекулярна маса — 141 785[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MIRLGAPQTL | VLLTLLVAAV | LRCQGQDVQE | AGSCVQDGQR | YNDKDVWKPE | ||||
PCRICVCDTG | TVLCDDIICE | DVKDCLSPEI | PFGECCPICP | TDLATASGQP | ||||
GPKGQKGEPG | DIKDIVGPKG | PPGPQGPAGE | QGPRGDRGDK | GEKGAPGPRG | ||||
RDGEPGTPGN | PGPPGPPGPP | GPPGLGGNFA | AQMAGGFDEK | AGGAQLGVMQ | ||||
GPMGPMGPRG | PPGPAGAPGP | QGFQGNPGEP | GEPGVSGPMG | PRGPPGPPGK | ||||
PGDDGEAGKP | GKAGERGPPG | PQGARGFPGT | PGLPGVKGHR | GYPGLDGAKG | ||||
EAGAPGVKGE | SGSPGENGSP | GPMGPRGLPG | ERGRTGPAGA | AGARGNDGQP | ||||
GPAGPPGPVG | PAGGPGFPGA | PGAKGEAGPT | GARGPEGAQG | PRGEPGTPGS | ||||
PGPAGASGNP | GTDGIPGAKG | SAGAPGIAGA | PGFPGPRGPP | GPQGATGPLG | ||||
PKGQTGEPGI | AGFKGEQGPK | GEPGPAGPQG | APGPAGEEGK | RGARGEPGGV | ||||
GPIGPPGERG | APGNRGFPGQ | DGLAGPKGAP | GERGPSGLAG | PKGANGDPGR | ||||
PGEPGLPGAR | GLTGRPGDAG | PQGKVGPSGA | PGEDGRPGPP | GPQGARGQPG | ||||
VMGFPGPKGA | NGEPGKAGEK | GLPGAPGLRG | LPGKDGETGA | AGPPGPAGPA | ||||
GERGEQGAPG | PSGFQGLPGP | PGPPGEGGKP | GDQGVPGEAG | APGLVGPRGE | ||||
RGFPGERGSP | GAQGLQGPRG | LPGTPGTDGP | KGASGPAGPP | GAQGPPGLQG | ||||
MPGERGAAGI | AGPKGDRGDV | GEKGPEGAPG | KDGGRGLTGP | IGPPGPAGAN | ||||
GEKGEVGPPG | PAGSAGARGA | PGERGETGPP | GPAGFAGPPG | ADGQPGAKGE | ||||
QGEAGQKGDA | GAPGPQGPSG | APGPQGPTGV | TGPKGARGAQ | GPPGATGFPG | ||||
AAGRVGPPGS | NGNPGPPGPP | GPSGKDGPKG | ARGDSGPPGR | AGEPGLQGPA | ||||
GPPGEKGEPG | DDGPSGAEGP | PGPQGLAGQR | GIVGLPGQRG | ERGFPGLPGP | ||||
SGEPGKQGAP | GASGDRGPPG | PVGPPGLTGP | AGEPGREGSP | GADGPPGRDG | ||||
AAGVKGDRGE | TGAVGAPGAP | GPPGSPGPAG | PTGKQGDRGE | AGAQGPMGPS | ||||
GPAGARGIQG | PQGPRGDKGE | AGEPGERGLK | GHRGFTGLQG | LPGPPGPSGD | ||||
QGASGPAGPS | GPRGPPGPVG | PSGKDGANGI | PGPIGPPGPR | GRSGETGPAG | ||||
PPGNPGPPGP | PGPPGPGIDM | SAFAGLGPRE | KGPDPLQYMR | ADQAAGGLRQ | ||||
HDAEVDATLK | SLNNQIESIR | SPEGSRKNPA | RTCRDLKLCH | PEWKSGDYWI | ||||
DPNQGCTLDA | MKVFCNMETG | ETCVYPNPAN | VPKKNWWSSK | SKEKKHIWFG | ||||
ETINGGFHFS | YGDDNLAPNT | ANVQMTFLRL | LSTEGSQNIT | YHCKNSIAYL | ||||
DEAAGNLKKA | LLIQGSNDVE | IRAEGNSRFT | YTALKDGCTK | HTGKWGKTVI | ||||
EYRSQKTSRL | PIIDIAPMDI | GGPEQEFGVD | IGPVCFL |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Su M.W., Lee B., Ramirez F., Machado M.A., Horton W.A. (1989). Nucleotide sequence of the full length cDNA encoding for human type II procollagen. Nucleic Acids Res. 17: 9473—9473. PMID 2587267 DOI:10.1093/nar/17.22.9473
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Baldwin C.T., Reginato A.M., Smith C., Jimenez S.A., Prockop D.J. (1989). Structure of cDNA clones coding for human type II procollagen. The alpha 1(II) chain is more similar to the alpha 1(I) chain than two other alpha chains of fibrillar collagens. Biochem. J. 262: 521—528. PMID 2803268 DOI:10.1042/bj2620521
- Su M.W., Benson-Chanda V., Vissing H., Ramirez F. (1989). Organization of the exons coding for pro alpha 1(II) collagen N-propeptide confirms a distinct evolutionary history of this domain of the fibrillar collagen genes. Genomics. 4: 438—441. PMID 2714801 DOI:10.1016/0888-7543(89)90353-4
- Ryan M.C., Sieraski M., Sandell L.J. (1990). The human type II procollagen gene: identification of an additional protein-coding domain and location of potential regulatory sequences in the promoter and first intron. Genomics. 8: 41—48. PMID 2081599 DOI:10.1016/0888-7543(90)90224-I
- Nunez A.M., Kohno K., Martin G.R., Yamada Y. (1986). Promoter region of the human pro-alpha 1(II)-collagen gene. Gene. 44: 11—16. PMID 3021582 DOI:10.1016/0378-1119(86)90037-5
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL2A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2200 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P02458 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
![]() |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|