COL1A1
COL1A1 (англ. Collagen type I alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 464 амінокислот, а молекулярна маса — 138 941[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MFSFVDLRLL | LLLAATALLT | HGQEEGQVEG | QDEDIPPITC | VQNGLRYHDR | ||||
DVWKPEPCRI | CVCDNGKVLC | DDVICDETKN | CPGAEVPEGE | CCPVCPDGSE | ||||
SPTDQETTGV | EGPKGDTGPR | GPRGPAGPPG | RDGIPGQPGL | PGPPGPPGPP | ||||
GPPGLGGNFA | PQLSYGYDEK | STGGISVPGP | MGPSGPRGLP | GPPGAPGPQG | ||||
FQGPPGEPGE | PGASGPMGPR | GPPGPPGKNG | DDGEAGKPGR | PGERGPPGPQ | ||||
GARGLPGTAG | LPGMKGHRGF | SGLDGAKGDA | GPAGPKGEPG | SPGENGAPGQ | ||||
MGPRGLPGER | GRPGAPGPAG | ARGNDGATGA | AGPPGPTGPA | GPPGFPGAVG | ||||
AKGEAGPQGP | RGSEGPQGVR | GEPGPPGPAG | AAGPAGNPGA | DGQPGAKGAN | ||||
GAPGIAGAPG | FPGARGPSGP | QGPGGPPGPK | GNSGEPGAPG | SKGDTGAKGE | ||||
PGPVGVQGPP | GPAGEEGKRG | ARGEPGPTGL | PGPPGERGGP | GSRGFPGADG | ||||
VAGPKGPAGE | RGSPGPAGPK | GSPGEAGRPG | EAGLPGAKGL | TGSPGSPGPD | ||||
GKTGPPGPAG | QDGRPGPPGP | PGARGQAGVM | GFPGPKGAAG | EPGKAGERGV | ||||
PGPPGAVGPA | GKDGEAGAQG | PPGPAGPAGE | RGEQGPAGSP | GFQGLPGPAG | ||||
PPGEAGKPGE | QGVPGDLGAP | GPSGARGERG | FPGERGVQGP | PGPAGPRGAN | ||||
GAPGNDGAKG | DAGAPGAPGS | QGAPGLQGMP | GERGAAGLPG | PKGDRGDAGP | ||||
KGADGSPGKD | GVRGLTGPIG | PPGPAGAPGD | KGESGPSGPA | GPTGARGAPG | ||||
DRGEPGPPGP | AGFAGPPGAD | GQPGAKGEPG | DAGAKGDAGP | PGPAGPAGPP | ||||
GPIGNVGAPG | AKGARGSAGP | PGATGFPGAA | GRVGPPGPSG | NAGPPGPPGP | ||||
AGKEGGKGPR | GETGPAGRPG | EVGPPGPPGP | AGEKGSPGAD | GPAGAPGTPG | ||||
PQGIAGQRGV | VGLPGQRGER | GFPGLPGPSG | EPGKQGPSGA | SGERGPPGPM | ||||
GPPGLAGPPG | ESGREGAPGA | EGSPGRDGSP | GAKGDRGETG | PAGPPGAPGA | ||||
PGAPGPVGPA | GKSGDRGETG | PAGPTGPVGP | VGARGPAGPQ | GPRGDKGETG | ||||
EQGDRGIKGH | RGFSGLQGPP | GPPGSPGEQG | PSGASGPAGP | RGPPGSAGAP | ||||
GKDGLNGLPG | PIGPPGPRGR | TGDAGPVGPP | GPPGPPGPPG | PPSAGFDFSF | ||||
LPQPPQEKAH | DGGRYYRADD | ANVVRDRDLE | VDTTLKSLSQ | QIENIRSPEG | ||||
SRKNPARTCR | DLKMCHSDWK | SGEYWIDPNQ | GCNLDAIKVF | CNMETGETCV | ||||
YPTQPSVAQK | NWYISKNPKD | KRHVWFGESM | TDGFQFEYGG | QGSDPADVAI | ||||
QLTFLRLMST | EASQNITYHC | KNSVAYMDQQ | TGNLKKALLL | QGSNEIEIRA | ||||
EGNSRFTYSV | TVDGCTSHTG | AWGKTVIEYK | TTKTSRLPII | DVAPLDVGAP | ||||
DQEFGFDVGP | VCFL |
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bornstein P., McKay J., Morishima J.K., Devarayalu S., Gelinas R.E. (1987). Regulatory elements in the first intron contribute to transcriptional control of the human alpha 1(I) collagen gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 8869—8873. PMID 3480516 DOI:10.1073/pnas.84.24.8869
- Click E.M., Bornstein P. (1970). Isolation and characterization of the cyanogen bromide peptides from the alpha 1 and alpha 2 chains of human skin collagen. Biochemistry. 9: 4699—4706. PMID 5529814 DOI:10.1021/bi00826a012
- Chu M.-L., Myers J.C., Bernard M.P., Ding J.-F., Ramirez F. (1982). Cloning and characterization of five overlapping cDNAs specific for the human pro alpha 1(I) collagen chain. Nucleic Acids Res. 10: 5925—5934. PMID 6183642 DOI:10.1093/nar/10.19.5925
- Barsh G.S., Roush C.L., Bonadio J., Byers P.H., Gelinas R.E. (1985). Intron-mediated recombination may cause a deletion in an alpha 1 type I collagen chain in a lethal form of osteogenesis imperfecta. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 2870—2874. PMID 3857621 DOI:10.1073/pnas.82.9.2870
- Maekelae J.K., Raassina M., Virta A., Vuorio E. (1988). Human pro alpha 1(I) collagen: cDNA sequence for the C-propeptide domain. Nucleic Acids Res. 16: 349—349. PMID 3340531 DOI:10.1093/nar/16.1.349
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL1A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2197 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P02452 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|