TRPM1

TRPM1
Ідентифікатори
Символи	TRPM1, CSNB1C, LTRPC1, MLSN1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603576 MGI: 1330305 HomoloGene: 19940 GeneCards: TRPM1
Пов'язані генетичні захворювання
congenital stationary night blindness 1C
Реагує на сполуку
pregnenolone sulfate
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium channel activity • ion channel activity • cation channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • new growing cell tip Біологічний процес • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • calcium ion transport into cytosol • відповідь на стимул • ion transport • protein tetramerization • calcium ion transmembrane transport • retinal rod cell development • cellular response to light stimulus • зір • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • cation transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4308	17364
Ensembl	ENSG00000274965 ENSG00000134160	ENSMUSG00000030523
UniProt	Q7Z4N2	Q2TV84
RefSeq (мРНК)	NM_001252020 NM_001252024 NM_001252030 NM_002420	NM_001039104 NM_018752
RefSeq (білок)	NP_001238949 NP_001238953 NP_001238959 NP_002411	NP_001034193 NP_061222
Локус (UCSC)	Хр. 15: 31 – 31.16 Mb	Хр. 7: 63.8 – 63.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPM1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 603 амінокислот, а молекулярна маса — 182 178.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKDSNRCCCG		QFTNQHIPPL		PSATPSKNEE		ESKQVETQPE		KWSVAKHTQS
YPTDSYGVLE		FQGGGYSNKA		MYIRVSYDTK		PDSLLHLMVK		DWQLELPKLL
ISVHGGLQNF		EMQPKLKQVF		GKGLIKAAMT		TGAWIFTGGV		STGVISHVGD
ALKDHSSKSR		GRVCAIGIAP		WGIVENKEDL		VGKDVTRVYQ		TMSNPLSKLS
VLNNSHTHFI		LADNGTLGKY		GAEVKLRRLL		EKHISLQKIN		TRLGQGVPLV
GLVVEGGPNV		VSIVLEYLQE		EPPIPVVICD		GSGRASDILS		FAHKYCEEGG
IINESLREQL		LVTIQKTFNY		NKAQSHQLFA		IIMECMKKKE		LVTVFRMGSE
GQQDIEMAIL		TALLKGTNVS		APDQLSLALA		WNRVDIARSQ		IFVFGPHWPP
LGSLAPPTDS		KATEKEKKPP		MATTKGGRGK		GKGKKKGKVK		EEVEEETDPR
KIELLNWVNA		LEQAMLDALV		LDRVDFVKLL		IENGVNMQHF		LTIPRLEELY
NTRLGPPNTL		HLLVRDVKKS		NLPPDYHISL		IDIGLVLEYL		MGGAYRCNYT
RKNFRTLYNN		LFGPKRPKAL		KLLGMEDDEP		PAKGKKKKKK		KKEEEIDIDV
DDPAVSRFQY		PFHELMVWAV		LMKRQKMAVF		LWQRGEESMA		KALVACKLYK
AMAHESSESD		LVDDISQDLD		NNSKDFGQLA		LELLDQSYKH		DEQIAMKLLT
YELKNWSNST		CLKLAVAAKH		RDFIAHTCSQ		MLLTDMWMGR		LRMRKNPGLK
VIMGILLPPT		ILFLEFRTYD		DFSYQTSKEN		EDGKEKEEEN		TDANADAGSR
KGDEENEHKK		QRSIPIGTKI		CEFYNAPIVK		FWFYTISYLG		YLLLFNYVIL
VRMDGWPSLQ		EWIVISYIVS		LALEKIREIL		MSEPGKLSQK		IKVWLQEYWN
ITDLVAISTF		MIGAILRLQN		QPYMGYGRVI		YCVDIIFWYI		RVLDIFGVNK
YLGPYVMMIG		KMMIDMLYFV		VIMLVVLMSF		GVARQAILHP		EEKPSWKLAR
NIFYMPYWMI		YGEVFADQID		LYAMEINPPC		GENLYDEEGK		RLPPCIPGAW
LTPALMACYL		LVANILLVNL		LIAVFNNTFF		EVKSISNQVW		KFQRYQLIMT
FHDRPVLPPP		MIILSHIYII		IMRLSGRCRK		KREGDQEERD		RGLKLFLSDE
ELKRLHEFEE		QCVQEHFREK		EDEQQSSSDE		RIRVTSERVE		NMSMRLEEIN
ERETFMKTSL		QTVDLRLAQL		EELSNRMVNA		LENLAGIDRS		DLIQARSRAS
SECEATYLLR		QSSINSADGY		SLYRYHFNGE		ELLFEDTSLS		TSPGTGVRKK
TCSFRIKEEK		DVKTHLVPEC		QNSLHLSLGT		STSATPDGSH		LAVDDLKNAE
ESKLGPDIGI		SKEDDERQTD		SKKEETISPS		LNKTDVIHGQ		DKSDVQNTQL
TVETTNIEGT		ISYPLEETKI		TRYFPDETIN		ACKTMKSRSF		VYSRGRKLVG
GVNQDVEYSS		ITDQQLTTEW		QCQVQKITRS		HSTDIPYIVS		EAAVQAEHKE
QFADMQDEHH		VAEAIPRIPR		LSLTITDRNG		MENLLSVKPD		QTLGFPSLRS
KSLHGHPRNV		KSIQGKLDRS		GHASSVSSLV		IVSGMTAEEK		KVKKEKASTE
TEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fang D., Setaluri V. (2000). Expression and up-regulation of alternatively spliced transcripts of melastatin, a melanoma metastasis-related gene, in human melanoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 53—61. PMID 11112417 DOI:10.1006/bbrc.2000.3894
• Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198

Див. також

• Хромосома 15