З 2011 року очолював тренерський штаб туринського «Ювентуса». Залишив позицію в туринському клубі 15 липня 2014 року. На той час, після провального виступу національної збірної Італії на чемпіонаті світу 2014, вже було звільнено її очильника Чезаре Пранделлі, і 14 серпня 2014 року було оголошено, що новим головним тренером італійської збірної призначено Конте.
4 квітня 2016 був призначений головним тренером «Челсі», який приступив до своїх обов'язків відразу після закінчення Чемпіонату Європи-2016. У своєму першому сезоні в Англії італієць зумів привести «аристократів» до перемоги у Прем'єр-лізі. Утім наступного сезону команде не лише не захистила чемпіонський титул, але, посівши лише п'яте місце, опинилася поза зоною Ліги чемпіонів. Тож, попри здобуття кубка Англії того сезону, влітку 2018 року Конте був відправлений у відставку керівництвом «Челсі».
31 травня 2019 року, після річного відпочинку, тренер очолив штаб міланського клубу «Інтернаціонале». У червні 2021 року пішов з посади, а його місце посів Сімоне Індзагі[1].
2 листопада 2021 року став головним тренером англійського клубу «Тоттенгем Готспур»[2], з яким було підписано контракт до літа 2023 року[3].