CD48

CD48
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EDO
Ідентифікатори
Символи	CD48, BCM1, BLAST, BLAST1, MEM-102, SLAMF2, hmCD48 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 109530 MGI: 88339 HomoloGene: 1347 GeneCards: CD48
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • membrane raft • anchored component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • екзосома • мембрана • intrinsic component of plasma membrane Біологічний процес • defense response • leukocyte migration • regulation of adaptive immune response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	962	12506
Ensembl	ENSG00000117091	ENSMUSG00000015355
UniProt	P09326	P18181
RefSeq (мРНК)	NM_001256030 NM_001778	NM_007649 NM_001360767
RefSeq (білок)	NP_001242959 NP_001769	NP_031675 NP_001347696
Локус (UCSC)	Хр. 1: 160.68 – 160.71 Mb	Хр. 1: 171.51 – 171.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD48 (англ. CD48 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 27 683.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCSRGWDSCL		ALELLLLPLS		LLVTSIQGHL		VHMTVVSGSN		VTLNISESLP
ENYKQLTWFY		TFDQKIVEWD		SRKSKYFESK		FKGRVRLDPQ		SGALYISKVQ
KEDNSTYIMR		VLKKTGNEQE		WKIKLQVLDP		VPKPVIKIEK		IEDMDDNCYL
KLSCVIPGES		VNYTWYGDKR		PFPKELQNSV		LETTLMPHNY		SRCYTCQVSN
SVSSKNGTVC		LSPPCTLARS		FGVEWIASWL		VVTVPTILGL		LLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Vaughan H.A., Henning M.M., Purcell D.F.J., McKenzie I.F.C., Sandrin M.S. (1991). The isolation of cDNA clones for CD48. Immunogenetics. 33: 113—117. PMID 1999351 DOI:10.1007/BF00210824
• Korinek V., Stefanova I., Angelisova P., Hilbert I., Horejsi V. (1991). The human leucocyte antigen CD48 (MEM-102) is closely related to the activation marker Blast-1. Immunogenetics. 33: 108—112. PMID 1999350 DOI:10.1007/BF00210823
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fisher R.C., Thorley-Lawson D.A. (1991). Characterization of the Epstein-Barr virus-inducible gene encoding the human leukocyte adhesion and activation antigen BLAST-1 (CD48). Mol. Cell. Biol. 11: 1614—1623. PMID 1847502 DOI:10.1128/MCB.11.3.1614
• Staunton D.E., Thorley-Lawson D.A. (1987). Molecular cloning of the lymphocyte activation marker Blast-1. EMBO J. 6: 3695—3701. PMID 2828034

Див. також

• Хромосома 1