TNFSF13

TNFSF13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZCH
Ідентифікатори
Символи	TNFSF13, APRIL, CD256, TALL-2, TALL2, TRDL-1, ZTNF2, UNQ383/PRO715, TNLG7B, tumor necrosis factor superfamily member 13, TNF superfamily member 13
Зовнішні ІД	OMIM: 604472 MGI: 1916833 HomoloGene: 56971 GeneCards: TNFSF13
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • tumor necrosis factor receptor binding • cytokine activity Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • нуклеоплазма • цитоплазма • екзосома • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of mRNA stability • positive regulation of cell population proliferation • процес імунної системи • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of isotype switching to IgA isotypes • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8741	69583
Ensembl	ENSG00000161955	ENSMUSG00000089669
UniProt	O75888	Q9D777
RefSeq (мРНК)	NM_001198622 NM_001198623 NM_001198624 NM_003808 NM_172087 NM_172088	NM_001159505 NM_023517
RefSeq (білок)	NP_001185551 NP_001185552 NP_001185553 NP_003799 NP_742084 NP_742085	NP_001152977 NP_076006
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.56 – 7.56 Mb	Хр. 11: 69.57 – 69.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFSF13 (англ. TNF superfamily member 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 27 433.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPASSPFLLA		PKGPPGNMGG		PVREPALSVA		LWLSWGAALG		AVACAMALLT
QQTELQSLRR		EVSRLQGTGG		PSQNGEGYPW		QSLPEQSSDA		LEAWENGERS
RKRRAVLTQK		QKKQHSVLHL		VPINATSKDD		SDVTEVMWQP		ALRRGRGLQA
QGYGVRIQDA		GVYLLYSQVL		FQDVTFTMGQ		VVSREGQGRQ		ETLFRCIRSM
PSHPDRAYNS		CYSAGVFHLH		QGDILSVIIP		RARAKLNLSP		HGTFLGFVKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lopez-Fraga M., Fernandez R., Albar J.P., Hahne M. (2001). Biologically active APRIL is secreted following intracellular processing in the Golgi apparatus by furin convertase. EMBO Rep. 2: 945—951. PMID 11571266 DOI:10.1093/embo-reports/kve198
• Shu H.-B., Hu W.-H., Johnson H. (1999). TALL-1 is a novel member of the TNF family that is down-regulated by mitogens. J. Leukoc. Biol. 65: 680—683. PMID 10331498
• Kelly K.A., Manos E.J., Jensen G.T., Nadauld L., Jones D.A. (2000). APRIL/TRDL-1, a tumor necrosis factor-like ligand, stimulates cell death. Cancer Res. 60: 1021—1027. PMID 10706119

Див. також

• Хромосома 17