LAMP1

LAMP1
Ідентифікатори
Символи	LAMP1, CD107a, LAMPA, LGP120, lysosomal associated membrane protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 153330 MGI: 96745 HomoloGene: 4061 GeneCards: LAMP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • virus receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • multivesicular body; • phagolysosome membrane; • везикула; • ендосома; • late endosome; • мембрана; • Синаптичні бульбашки; • cytolytic granule; • Меланосома; • integral component of plasma membrane; • alveolar lamellar body; • cell surface; • lysosomal membrane; • neuronal cell body; • вакуоля; • дендрит (нейробіологія); • phagocytic vesicle; • perinuclear region of cytoplasm; • Сарколема; • лізосома; • endosome membrane; • екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • external side of plasma membrane; • гіалоплазма; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • azurophil granule membrane; • autolysosome; • ficolin-1-rich granule membrane; • integral component of synaptic vesicle membrane; • late endosome membrane;
Біологічний процес	• protein stabilization; • Golgi to lysosome transport; • positive regulation of natural killer cell degranulation; • regulation of organelle transport along microtubule; • viral entry into host cell; • GO:0022415 viral process; • establishment of protein localization to organelle; • positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway; • autophagic cell death; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3916
	16783
	ENSG00000185896
	ENSMUSG00000031447
	P11279
	P11438
	NM_005561
	NM_010684; NM_001317353
	NP_005552
	NP_001304282; NP_034814
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LAMP1 (англ. Lysosomal associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 417 амінокислот, а молекулярна маса — 44 882^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPGSARRP	LLLLLLLLLL	GLMHCASAAM	FMVKNGNGTA	CIMANFSAAF
SVNYDTKSGP	KNMTFDLPSD	ATVVLNRSSC	GKENTSDPSL	VIAFGRGHTL
TLNFTRNATR	YSVQLMSFVY	NLSDTHLFPN	ASSKEIKTVE	SITDIRADID
KKYRCVSGTQ	VHMNNVTVTL	HDATIQAYLS	NSSFSRGETR	CEQDRPSPTT
APPAPPSPSP	SPVPKSPSVD	KYNVSGTNGT	CLLASMGLQL	NLTYERKDNT
TVTRLLNINP	NKTSASGSCG	AHLVTLELHS	EGTTVLLFQF	GMNASSSRFF
LQGIQLNTIL	PDARDPAFKA	ANGSLRALQA	TVGNSYKCNA	EEHVRVTKAF
SVNIFKVWVQ	AFKVEGGQFG	SVEECLLDEN	SMLIPIAVGG	ALAGLVLIVL
IAYLVGRKRS	HAGYQTI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Viitala J., Carlsson S.R., Siebert P.D., Fukuda M. (1988). Molecular cloning of cDNAs encoding lamp A, a human lysosomal membrane glycoprotein with apparent Mr approximately equal to 120,000. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 3743—3747. PMID 3131762 DOI:10.1073/pnas.85.11.3743
Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 DOI:10.1006/abbi.1993.1322
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Johansson M., Lehto M., Tanhuanpaeae K., Cover T.L., Olkkonen V.M. (2005). The oxysterol-binding protein homologue ORP1L interacts with Rab7 and alters functional properties of late endocytic compartments. Mol. Biol. Cell. 16: 5480—5492. PMID 16176980 DOI:10.1091/mbc.E05-03-0189
Fukuda M., Viitala J., Matteson J., Carlsson S.R. (1988). Cloning of cDNAs encoding human lysosomal membrane glycoproteins, h-lamp-1 and h-lamp-2. Comparison of their deduced amino acid sequences. J. Biol. Chem. 263: 18920—18928. PMID 3198605