ABCB1

ABCB1
Ідентифікатори
Символи	ABCB1, ABC20, CD243, CLCS, GP170, MDR1, P-GP, PGY1, ATP binding cassette subfamily B member 1, P-glycoprotein, P-gp, Pgp
Зовнішні ІД	OMIM: 171050 MGI: 97570 HomoloGene: 55496 GeneCards: ABCB1
Пов'язані генетичні захворювання
inflammatory bowel disease 13
Онтологія гена Молекулярна функція • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • nucleotide binding • transporter activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ABC-type xenobiotic transporter activity • phosphatidylethanolamine flippase activity • phosphatidylcholine floppase activity • ceramide floppase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • екзосома • apical plasma membrane Біологічний процес • stem cell proliferation • xenobiotic transport • G2/M transition of mitotic cell cycle • трансмембранний транспорт • phospholipid translocation • xenobiotic transmembrane transport • ceramide translocation • regulation of response to osmotic stress • positive regulation of anion channel activity • regulation of chloride transport • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5243	18671
Ensembl	ENSG00000085563	ENSMUSG00000040584
UniProt	P08183	P21447
RefSeq (мРНК)	NM_000927	NM_011076
RefSeq (білок)	NP_000918 NP_001335873 NP_001335874 NP_001335875	NP_035206
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 5: 8.71 – 8.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ABCB1 (англ. ATP binding cassette subfamily B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 280 амінокислот, а молекулярна маса — 141 479.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLEGDRNGG		AKKKNFFKLN		NKSEKDKKEK		KPTVSVFSMF		RYSNWLDKLY
MVVGTLAAII		HGAGLPLMML		VFGEMTDIFA		NAGNLEDLMS		NITNRSDIND
TGFFMNLEED		MTRYAYYYSG		IGAGVLVAAY		IQVSFWCLAA		GRQIHKIRKQ
FFHAIMRQEI		GWFDVHDVGE		LNTRLTDDVS		KINEGIGDKI		GMFFQSMATF
FTGFIVGFTR		GWKLTLVILA		ISPVLGLSAA		VWAKILSSFT		DKELLAYAKA
GAVAEEVLAA		IRTVIAFGGQ		KKELERYNKN		LEEAKRIGIK		KAITANISIG
AAFLLIYASY		ALAFWYGTTL		VLSGEYSIGQ		VLTVFFSVLI		GAFSVGQASP
SIEAFANARG		AAYEIFKIID		NKPSIDSYSK		SGHKPDNIKG		NLEFRNVHFS
YPSRKEVKIL		KGLNLKVQSG		QTVALVGNSG		CGKSTTVQLM		QRLYDPTEGM
VSVDGQDIRT		INVRFLREII		GVVSQEPVLF		ATTIAENIRY		GRENVTMDEI
EKAVKEANAY		DFIMKLPHKF		DTLVGERGAQ		LSGGQKQRIA		IARALVRNPK
ILLLDEATSA		LDTESEAVVQ		VALDKARKGR		TTIVIAHRLS		TVRNADVIAG
FDDGVIVEKG		NHDELMKEKG		IYFKLVTMQT		AGNEVELENA		ADESKSEIDA
LEMSSNDSRS		SLIRKRSTRR		SVRGSQAQDR		KLSTKEALDE		SIPPVSFWRI
MKLNLTEWPY		FVVGVFCAII		NGGLQPAFAI		IFSKIIGVFT		RIDDPETKRQ
NSNLFSLLFL		ALGIISFITF		FLQGFTFGKA		GEILTKRLRY		MVFRSMLRQD
VSWFDDPKNT		TGALTTRLAN		DAAQVKGAIG		SRLAVITQNI		ANLGTGIIIS
FIYGWQLTLL		LLAIVPIIAI		AGVVEMKMLS		GQALKDKKEL		EGSGKIATEA
IENFRTVVSL		TQEQKFEHMY		AQSLQVPYRN		SLRKAHIFGI		TFSFTQAMMY
FSYAGCFRFG		AYLVAHKLMS		FEDVLLVFSA		VVFGAMAVGQ		VSSFAPDYAK
AKISAAHIIM		IIEKTPLIDS		YSTEGLMPNT		LEGNVTFGEV		VFNYPTRPDI
PVLQGLSLEV		KKGQTLALVG		SSGCGKSTVV		QLLERFYDPL		AGKVLLDGKE
IKRLNVQWLR		AHLGIVSQEP		ILFDCSIAEN		IAYGDNSRVV		SQEEIVRAAK
EANIHAFIES		LPNKYSTKVG		DKGTQLSGGQ		KQRIAIARAL		VRQPHILLLD
EATSALDTES		EKVVQEALDK		AREGRTCIVI		AHRLSTIQNA		DLIVVFQNGR
VKEHGTHQQL		LAQKGIYFSM		VSVQAGTKRQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Gekeler V., Weger S., Probst H. (1990). mdr1/P-glycoprotein gene segments analyzed from various human leukemic cell lines exhibiting different multidrug resistance profiles. Biochem. Biophys. Res. Commun. 169: 796—802. PMID 1972623 DOI:10.1016/0006-291X(90)90401-8
• Kerb R., Hoffmeyer S., Brinkmann U. (2001). ABC drug transporters: hereditary polymorphisms and pharmacological impact in MDR1, MRP1 and MRP2. Pharmacogenomics. 2: 51—64. PMID 11258197 DOI:10.1517/14622416.2.1.51
• Begley G.S., Horvath A.R., Taylor J.C., Higgins C.F. (2005). Cytoplasmic domains of the transporter associated with antigen processing and P-glycoprotein interact with subunits of the proteasome. Mol. Immunol. 42: 137—141. PMID 15488952 DOI:10.1016/j.molimm.2004.07.005
• Katayama K., Yamaguchi M., Noguchi K., Sugimoto Y. (2014). Protein phosphatase complex PP5/PPP2R3C dephosphorylates P-glycoprotein/ABCB1 and down-regulates the expression and function. Cancer Lett. 345: 124—131. PMID 24333728 DOI:10.1016/j.canlet.2013.12.007
• Choi K.H., Chen C.-J., Kriegler M., Roninson I.B. (1988). An altered pattern of cross-resistance in multidrug-resistant human cells results from spontaneous mutations in the mdr1 (P-glycoprotein) gene. Cell. 53: 519—529. PMID 2897240 DOI:10.1016/0092-8674(88)90568-5
• Decleves X., Chevillard S., Charpentier C., Vielh P., Laplanche J.-L. (2000). A new polymorphism (N21D) in the exon 2 of the human MDR1 gene encoding the P-glycoprotein. Hum. Mutat. 15: 486—486. PMID 10790226 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(200005)15:5<486::AID-HUMU26>3.0.CO;2-P

Див. також

• Хромосома 7