LRP1
LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLTPPLLLLL | PLLSALVAAA | IDAPKTCSPK | QFACRDQITC | ISKGWRCDGE | ||||
RDCPDGSDEA | PEICPQSKAQ | RCQPNEHNCL | GTELCVPMSR | LCNGVQDCMD | ||||
GSDEGPHCRE | LQGNCSRLGC | QHHCVPTLDG | PTCYCNSSFQ | LQADGKTCKD | ||||
FDECSVYGTC | SQLCTNTDGS | FICGCVEGYL | LQPDNRSCKA | KNEPVDRPPV | ||||
LLIANSQNIL | ATYLSGAQVS | TITPTSTRQT | TAMDFSYANE | TVCWVHVGDS | ||||
AAQTQLKCAR | MPGLKGFVDE | HTINISLSLH | HVEQMAIDWL | TGNFYFVDDI | ||||
DDRIFVCNRN | GDTCVTLLDL | ELYNPKGIAL | DPAMGKVFFT | DYGQIPKVER | ||||
CDMDGQNRTK | LVDSKIVFPH | GITLDLVSRL | VYWADAYLDY | IEVVDYEGKG | ||||
RQTIIQGILI | EHLYGLTVFE | NYLYATNSDN | ANAQQKTSVI | RVNRFNSTEY | ||||
QVVTRVDKGG | ALHIYHQRRQ | PRVRSHACEN | DQYGKPGGCS | DICLLANSHK | ||||
ARTCRCRSGF | SLGSDGKSCK | KPEHELFLVY | GKGRPGIIRG | MDMGAKVPDE | ||||
HMIPIENLMN | PRALDFHAET | GFIYFADTTS | YLIGRQKIDG | TERETILKDG | ||||
IHNVEGVAVD | WMGDNLYWTD | DGPKKTISVA | RLEKAAQTRK | TLIEGKMTHP | ||||
RAIVVDPLNG | WMYWTDWEED | PKDSRRGRLE | RAWMDGSHRD | IFVTSKTVLW | ||||
PNGLSLDIPA | GRLYWVDAFY | DRIETILLNG | TDRKIVYEGP | ELNHAFGLCH | ||||
HGNYLFWTEY | RSGSVYRLER | GVGGAPPTVT | LLRSERPPIF | EIRMYDAQQQ | ||||
QVGTNKCRVN | NGGCSSLCLA | TPGSRQCACA | EDQVLDADGV | TCLANPSYVP | ||||
PPQCQPGEFA | CANSRCIQER | WKCDGDNDCL | DNSDEAPALC | HQHTCPSDRF | ||||
KCENNRCIPN | RWLCDGDNDC | GNSEDESNAT | CSARTCPPNQ | FSCASGRCIP | ||||
ISWTCDLDDD | CGDRSDESAS | CAYPTCFPLT | QFTCNNGRCI | NINWRCDNDN | ||||
DCGDNSDEAG | CSHSCSSTQF | KCNSGRCIPE | HWTCDGDNDC | GDYSDETHAN | ||||
CTNQATRPPG | GCHTDEFQCR | LDGLCIPLRW | RCDGDTDCMD | SSDEKSCEGV | ||||
THVCDPSVKF | GCKDSARCIS | KAWVCDGDND | CEDNSDEENC | ESLACRPPSH | ||||
PCANNTSVCL | PPDKLCDGND | DCGDGSDEGE | LCDQCSLNNG | GCSHNCSVAP | ||||
GEGIVCSCPL | GMELGPDNHT | CQIQSYCAKH | LKCSQKCDQN | KFSVKCSCYE | ||||
GWVLEPDGES | CRSLDPFKPF | IIFSNRHEIR | RIDLHKGDYS | VLVPGLRNTI | ||||
ALDFHLSQSA | LYWTDVVEDK | IYRGKLLDNG | ALTSFEVVIQ | YGLATPEGLA | ||||
VDWIAGNIYW | VESNLDQIEV | AKLDGTLRTT | LLAGDIEHPR | AIALDPRDGI | ||||
LFWTDWDASL | PRIEAASMSG | AGRRTVHRET | GSGGWPNGLT | VDYLEKRILW | ||||
IDARSDAIYS | ARYDGSGHME | VLRGHEFLSH | PFAVTLYGGE | VYWTDWRTNT | ||||
LAKANKWTGH | NVTVVQRTNT | QPFDLQVYHP | SRQPMAPNPC | EANGGQGPCS | ||||
HLCLINYNRT | VSCACPHLMK | LHKDNTTCYE | FKKFLLYARQ | MEIRGVDLDA | ||||
PYYNYIISFT | VPDIDNVTVL | DYDAREQRVY | WSDVRTQAIK | RAFINGTGVE | ||||
TVVSADLPNA | HGLAVDWVSR | NLFWTSYDTN | KKQINVARLD | GSFKNAVVQG | ||||
LEQPHGLVVH | PLRGKLYWTD | GDNISMANMD | GSNRTLLFSG | QKGPVGLAID | ||||
FPESKLYWIS | SGNHTINRCN | LDGSGLEVID | AMRSQLGKAT | ALAIMGDKLW | ||||
WADQVSEKMG | TCSKADGSGS | VVLRNSTTLV | MHMKVYDESI | QLDHKGTNPC | ||||
SVNNGDCSQL | CLPTSETTRS | CMCTAGYSLR | SGQQACEGVG | SFLLYSVHEG | ||||
IRGIPLDPND | KSDALVPVSG | TSLAVGIDFH | AENDTIYWVD | MGLSTISRAK | ||||
RDQTWREDVV | TNGIGRVEGI | AVDWIAGNIY | WTDQGFDVIE | VARLNGSFRY | ||||
VVISQGLDKP | RAITVHPEKG | YLFWTEWGQY | PRIERSRLDG | TERVVLVNVS | ||||
ISWPNGISVD | YQDGKLYWCD | ARTDKIERID | LETGENREVV | LSSNNMDMFS | ||||
VSVFEDFIYW | SDRTHANGSI | KRGSKDNATD | SVPLRTGIGV | QLKDIKVFNR | ||||
DRQKGTNVCA | VANGGCQQLC | LYRGRGQRAC | ACAHGMLAED | GASCREYAGY | ||||
LLYSERTILK | SIHLSDERNL | NAPVQPFEDP | EHMKNVIALA | FDYRAGTSPG | ||||
TPNRIFFSDI | HFGNIQQIND | DGSRRITIVE | NVGSVEGLAY | HRGWDTLYWT | ||||
SYTTSTITRH | TVDQTRPGAF | ERETVITMSG | DDHPRAFVLD | ECQNLMFWTN | ||||
WNEQHPSIMR | AALSGANVLT | LIEKDIRTPN | GLAIDHRAEK | LYFSDATLDK | ||||
IERCEYDGSH | RYVILKSEPV | HPFGLAVYGE | HIFWTDWVRR | AVQRANKHVG | ||||
SNMKLLRVDI | PQQPMGIIAV | ANDTNSCELS | PCRINNGGCQ | DLCLLTHQGH | ||||
VNCSCRGGRI | LQDDLTCRAV | NSSCRAQDEF | ECANGECINF | SLTCDGVPHC | ||||
KDKSDEKPSY | CNSRRCKKTF | RQCSNGRCVS | NMLWCNGADD | CGDGSDEIPC | ||||
NKTACGVGEF | RCRDGTCIGN | SSRCNQFVDC | EDASDEMNCS | ATDCSSYFRL | ||||
GVKGVLFQPC | ERTSLCYAPS | WVCDGANDCG | DYSDERDCPG | VKRPRCPLNY | ||||
FACPSGRCIP | MSWTCDKEDD | CEHGEDETHC | NKFCSEAQFE | CQNHRCISKQ | ||||
WLCDGSDDCG | DGSDEAAHCE | GKTCGPSSFS | CPGTHVCVPE | RWLCDGDKDC | ||||
ADGADESIAA | GCLYNSTCDD | REFMCQNRQC | IPKHFVCDHD | RDCADGSDES | ||||
PECEYPTCGP | SEFRCANGRC | LSSRQWECDG | ENDCHDQSDE | APKNPHCTSQ | ||||
EHKCNASSQF | LCSSGRCVAE | ALLCNGQDDC | GDSSDERGCH | INECLSRKLS | ||||
GCSQDCEDLK | IGFKCRCRPG | FRLKDDGRTC | ADVDECSTTF | PCSQRCINTH | ||||
GSYKCLCVEG | YAPRGGDPHS | CKAVTDEEPF | LIFANRYYLR | KLNLDGSNYT | ||||
LLKQGLNNAV | ALDFDYREQM | IYWTDVTTQG | SMIRRMHLNG | SNVQVLHRTG | ||||
LSNPDGLAVD | WVGGNLYWCD | KGRDTIEVSK | LNGAYRTVLV | SSGLREPRAL | ||||
VVDVQNGYLY | WTDWGDHSLI | GRIGMDGSSR | SVIVDTKITW | PNGLTLDYVT | ||||
ERIYWADARE | DYIEFASLDG | SNRHVVLSQD | IPHIFALTLF | EDYVYWTDWE | ||||
TKSINRAHKT | TGTNKTLLIS | TLHRPMDLHV | FHALRQPDVP | NHPCKVNNGG | ||||
CSNLCLLSPG | GGHKCACPTN | FYLGSDGRTC | VSNCTASQFV | CKNDKCIPFW | ||||
WKCDTEDDCG | DHSDEPPDCP | EFKCRPGQFQ | CSTGICTNPA | FICDGDNDCQ | ||||
DNSDEANCDI | HVCLPSQFKC | TNTNRCIPGI | FRCNGQDNCG | DGEDERDCPE | ||||
VTCAPNQFQC | SITKRCIPRV | WVCDRDNDCV | DGSDEPANCT | QMTCGVDEFR | ||||
CKDSGRCIPA | RWKCDGEDDC | GDGSDEPKEE | CDERTCEPYQ | FRCKNNRCVP | ||||
GRWQCDYDND | CGDNSDEESC | TPRPCSESEF | SCANGRCIAG | RWKCDGDHDC | ||||
ADGSDEKDCT | PRCDMDQFQC | KSGHCIPLRW | RCDADADCMD | GSDEEACGTG | ||||
VRTCPLDEFQ | CNNTLCKPLA | WKCDGEDDCG | DNSDENPEEC | ARFVCPPNRP | ||||
FRCKNDRVCL | WIGRQCDGTD | NCGDGTDEED | CEPPTAHTTH | CKDKKEFLCR | ||||
NQRCLSSSLR | CNMFDDCGDG | SDEEDCSIDP | KLTSCATNAS | ICGDEARCVR | ||||
TEKAAYCACR | SGFHTVPGQP | GCQDINECLR | FGTCSQLCNN | TKGGHLCSCA | ||||
RNFMKTHNTC | KAEGSEYQVL | YIADDNEIRS | LFPGHPHSAY | EQAFQGDESV | ||||
RIDAMDVHVK | AGRVYWTNWH | TGTISYRSLP | PAAPPTTSNR | HRRQIDRGVT | ||||
HLNISGLKMP | RGIAIDWVAG | NVYWTDSGRD | VIEVAQMKGE | NRKTLISGMI | ||||
DEPHAIVVDP | LRGTMYWSDW | GNHPKIETAA | MDGTLRETLV | QDNIQWPTGL | ||||
AVDYHNERLY | WADAKLSVIG | SIRLNGTDPI | VAADSKRGLS | HPFSIDVFED | ||||
YIYGVTYINN | RVFKIHKFGH | SPLVNLTGGL | SHASDVVLYH | QHKQPEVTNP | ||||
CDRKKCEWLC | LLSPSGPVCT | CPNGKRLDNG | TCVPVPSPTP | PPDAPRPGTC | ||||
NLQCFNGGSC | FLNARRQPKC | RCQPRYTGDK | CELDQCWEHC | RNGGTCAASP | ||||
SGMPTCRCPT | GFTGPKCTQQ | VCAGYCANNS | TCTVNQGNQP | QCRCLPGFLG | ||||
DRCQYRQCSG | YCENFGTCQM | AADGSRQCRC | TAYFEGSRCE | VNKCSRCLEG | ||||
ACVVNKQSGD | VTCNCTDGRV | APSCLTCVGH | CSNGGSCTMN | SKMMPECQCP | ||||
PHMTGPRCEE | HVFSQQQPGH | IASILIPLLL | LLLLVLVAGV | VFWYKRRVQG | ||||
AKGFQHQRMT | NGAMNVEIGN | PTYKMYEGGE | PDDVGGLLDA | DFALDPDKPT | ||||
NFTNPVYATL | YMGGHGSRHS | LASTDEKREL | LGRGPEDEIG | DPLA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.
Література
- Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms. Genomics. 52: 138—144. PMID 9782078 DOI:10.1006/geno.1998.5408
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain. J. Biol. Chem. 277: 18736—18743. PMID 11907044 DOI:10.1074/jbc.M201979200
- Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65. J. Biol. Chem. 278: 41182—41188. PMID 12888553 DOI:10.1074/jbc.M306403200
- May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment. Traffic. 4: 291—301. PMID 12713657 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
- Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein. J. Biol. Chem. 274: 14130—14136. PMID 10318830 DOI:10.1074/jbc.274.20.14130
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q07954 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |