VCAM1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
VCAM1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_080682
NM_001078
NM_001199834
NM_011693
RefSeq (білок)
NP_001069
NP_001186763
NP_542413
NP_035823
Локус (UCSC) Хр. 1: 100.72 – 100.74 Mb Хр. 3: 115.9 – 115.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTT
GCESPFFSWRTQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCE
SRKLEKGIQVEIYSFPKDPEIHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEI
DLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEVTFTPVIEDIGKVLVCRAKLH
IDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGGSVTMTCSSEG
LPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN
RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQ
IDSPLSGKVRSEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVEL
YSFPRDPEIEMSGGLVNGSSVTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENI
EFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKALVCQAKLHIDDMEFEPKQRQ
STQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFPAPKILWSRQL
PNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP
KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSID
GAYTIRKAQLKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELL
VLYFASSLIIPAIGMIIYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

  • Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1). Nucleic Acids Res. 18: 5901—5901. PMID 1699207 DOI:10.1093/nar/18.19.5901
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1. J. Exp. Med. 176: 99—107. PMID 1377228 DOI:10.1084/jem.176.1.99
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). J. Biol. Chem. 267: 16323—16329. PMID 1379595

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, P19320 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також