DDR1
DDR1 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 101 128[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGPEALSSLL | LLLLVASGDA | DMKGHFDPAK | CRYALGMQDR | TIPDSDISAS | ||||
SSWSDSTAAR | HSRLESSDGD | GAWCPAGSVF | PKEEEYLQVD | LQRLHLVALV | ||||
GTQGRHAGGL | GKEFSRSYRL | RYSRDGRRWM | GWKDRWGQEV | ISGNEDPEGV | ||||
VLKDLGPPMV | ARLVRFYPRA | DRVMSVCLRV | ELYGCLWRDG | LLSYTAPVGQ | ||||
TMYLSEAVYL | NDSTYDGHTV | GGLQYGGLGQ | LADGVVGLDD | FRKSQELRVW | ||||
PGYDYVGWSN | HSFSSGYVEM | EFEFDRLRAF | QAMQVHCNNM | HTLGARLPGG | ||||
VECRFRRGPA | MAWEGEPMRH | NLGGNLGDPR | ARAVSVPLGG | RVARFLQCRF | ||||
LFAGPWLLFS | EISFISDVVN | NSSPALGGTF | PPAPWWPPGP | PPTNFSSLEL | ||||
EPRGQQPVAK | AEGSPTAILI | GCLVAIILLL | LLIIALMLWR | LHWRRLLSKA | ||||
ERRVLEEELT | VHLSVPGDTI | LINNRPGPRE | PPPYQEPRPR | GNPPHSAPCV | ||||
PNGSALLLSN | PAYRLLLATY | ARPPRGPGPP | TPAWAKPTNT | QAYSGDYMEP | ||||
EKPGAPLLPP | PPQNSVPHYA | EADIVTLQGV | TGGNTYAVPA | LPPGAVGDGP | ||||
PRVDFPRSRL | RFKEKLGEGQ | FGEVHLCEVD | SPQDLVSLDF | PLNVRKGHPL | ||||
LVAVKILRPD | ATKNARNDFL | KEVKIMSRLK | DPNIIRLLGV | CVQDDPLCMI | ||||
TDYMENGDLN | QFLSAHQLED | KAAEGAPGDG | QAAQGPTISY | PMLLHVAAQI | ||||
ASGMRYLATL | NFVHRDLATR | NCLVGENFTI | KIADFGMSRN | LYAGDYYRVQ | ||||
GRAVLPIRWM | AWECILMGKF | TTASDVWAFG | VTLWEVLMLC | RAQPFGQLTD | ||||
EQVIENAGEF | FRDQGRQVYL | SRPPACPQGL | YELMLRCWSR | ESEQRPPFSQ | ||||
LHRFLAEDAL | NTV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Johnson J.D., Edman J.C., Rutter W.J. (1993). A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5677—5681. PMID 8390675 DOI:10.1073/pnas.90.12.5677
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Weiner T.M., Liu E.T., Craven R.J., Cance W.G. (1994). Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors. Ann. Surg. Oncol. 1: 18—27. PMID 7834423 DOI:10.1007/BF02303537
- Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
- Hou G., Vogel W.F., Bendeck M.P. (2002). Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression. Circ. Res. 90: 1147—1149. PMID 12065315 DOI:10.1161/01.RES.0000022166.74073.F8
- Huang Y., Arora P., McCulloch C.A., Vogel W.F. (2009). The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA. J. Cell Sci. 122: 1637—1646. PMID 19401332 DOI:10.1242/jcs.046219
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q08345 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |