Народився в 1935 році в місті Чанчунь (у той час — столиця маріонеткової японської держави Маньчжоу-го, в наш час[коли?] входить до Китаю). У 1958 році закінчив Університет Токіо. Отримав ступінь доктора філософії в Пенсільванському університеті в 1963 році. Після отримання диплому деякий час працював у компанії (Teijin)), потім переїхав до США, де розпочав роботу в Університеті Пердью з Гербертом Брауном. У 1968 році отримав посаду асистент-професора. У 1972–1979 роках працював у Сіракузькому університеті, спочатку на посаді асистент-професора, а з 1976 року як професор. У 1979 році повертається до Університету Пердью на посаду повного професора.
Головна сфера наукових інтересів Еїті Негісі — каталізаційні реакції паладію та нікелю. У наукових колах став загальновідомим термін «Реакція Негісі», що позначає реакції з органометалевими сполуками цинку, алюмінію та цирконію.[3] Реакція Негісі споріднена з реакцією Судзукі, першовідкривач якої, Судзукі Акіра, також відзначений Нобелівською премією з хімії за 2010 рік.