Кератин-1

Кератин-1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZRY
Ідентифікатори
Символи	KRT1, CK1, EHK, EHK1, EPPK, K1, KRT1A, NEPPK, keratin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 139350 MGI: 96698 HomoloGene: 38146 GeneCards: KRT1
Пов'язані генетичні захворювання
epidermolytic hyperkeratosis
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity • carbohydrate binding • structural constituent of skin epidermis • signaling receptor activity • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • Проміжні філаменти • GO:0005578 Позаклітинна матриця • blood microparticle • клітинна мембрана • keratin filament • цитоскелет • мембрана • клітинне ядро • екзосома • extracellular region • міжклітинний простір • гіалоплазма • ficolin-1-rich granule lumen • cornified envelope • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • complement activation, lectin pathway • retina homeostasis • regulation of angiogenesis • negative regulation of inflammatory response • GO:0001306 response to oxidative stress • фібриноліз • establishment of skin barrier • keratinization • neutrophil degranulation • cornification • GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking • protein heterotetramerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3848	16678
Ensembl	ENSG00000167768	ENSMUSG00000046834
UniProt	P04264	P04104
RefSeq (мРНК)	NM_006121	NM_008473
RefSeq (білок)	NP_006112	NP_032499
Локус (UCSC)	Хр. 12: 52.67 – 52.68 Mb	Хр. 15: 101.75 – 101.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кератин-1 (англ. Keratin 1) — білок, який кодується геном KRT1, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 66 039. Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRQFSSRSG		YRSGGGFSSG		SAGIINYQRR		TTSSSTRRSG		GGGGRFSSCG
GGGGSFGAGG		GFGSRSLVNL		GGSKSISISV		ARGGGRGSGF		GGGYGGGGFG
GGGFGGGGFG		GGGIGGGGFG		GFGSGGGGFG		GGGFGGGGYG		GGYGPVCPPG
GIQEVTINQS		LLQPLNVEID		PEIQKVKSRE		REQIKSLNNQ		FASFIDKVRF
LEQQNQVLQT		KWELLQQVDT		STRTHNLEPY		FESFINNLRR		RVDQLKSDQS
RLDSELKNMQ		DMVEDYRNKY		EDEINKRTNA		ENEFVTIKKD		VDGAYMTKVD
LQAKLDNLQQ		EIDFLTALYQ		AELSQMQTQI		SETNVILSMD		NNRSLDLDSI
IAEVKAQYED		IAQKSKAEAE		SLYQSKYEEL		QITAGRHGDS		VRNSKIEISE
LNRVIQRLRS		EIDNVKKQIS		NLQQSISDAE		QRGENALKDA		KNKLNDLEDA
LQQAKEDLAR		LLRDYQELMN		TKLALDLEIA		TYRTLLEGEE		SRMSGECAPN
VSVSVSTSHT		TISGGGSRGG		GGGGYGSGGS		SYGSGGGSYG		SGGGGGGGRG
SYGSGGSSYG		SGGGSYGSGG		GGGGHGSYGS		GSSSGGYRGG		SGGGGGGSSG
GRGSGGGSSG		GSIGGRGSSS		GGVKSSGGSS		SVKFVSTTYS		GVTR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані.

Література

• Johnson L.D., Idler W.W., Zhou X.-M., Roop D.R., Steinert P.M. (1985). Structure of a gene for the human epidermal 67-kDa keratin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 1896—1900. PMID 2580302 DOI:10.1073/pnas.82.7.1896
• Whittock N.V., Eady R.A.J., McGrath J.A. (2000). Genomic organization and amplification of the human epidermal type II keratin genes K1 and K5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 149—152. PMID 10903910 DOI:10.1006/bbrc.2000.3110
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Senshu T., Kan S., Ogawa H., Manabe M., Asaga H. (1996). Preferential deimination of keratin K1 and filaggrin during the terminal differentiation of human epidermis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 225: 712—719. PMID 8780679 DOI:10.1006/bbrc.1996.1240
• Wang W., Sumiyoshi H., Yoshioka H., Fujiwara S. (2006). Interactions between epiplakin and intermediate filaments. J. Dermatol. 33: 518—527. PMID 16923132 DOI:10.1111/j.1346-8138.2006.00127.x
• Chuang N.N., Huang C.C. (2007). Interaction of integrin beta1 with cytokeratin 1 in neuroblastoma NMB7 cells. Biochem. Soc. Trans. 35: 1292—1294. PMID 17956333 DOI:10.1042/BST0351292

Див. також

• Хромосома 12