SYNM

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SYNM
Ідентифікатори
Символи SYNM, DMN, SYN, synemin
Зовнішні ІД OMIM: 606087 MGI: 2661187 HomoloGene: 9081 GeneCards: SYNM
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_145728
NM_015286
NM_183312
NM_201639
NM_207663
RefSeq (білок)
NP_056101
NP_663780
NP_899135
NP_964001
NP_997546
Локус (UCSC) Хр. 15: 99.1 – 99.14 Mb Хр. 7: 67.73 – 67.76 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SYNM (англ. Synemin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 565 амінокислот, а молекулярна маса — 172 768[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLSWRLQTGPEKAELQELNARLYDYVCRVRELERENLLLEEELRGRRGRE
GLWAEGQARCAEEARSLRQQLDELSWATALAEGERDALRRELRELQRLDA
EERAARGRLDAELGAQQRELQEALGARAALEALLGRLQAERRGLDAAHER
DVRELRARAASLTMHFRARATGPAAPPPRLREVHDSYALLVAESWRETVQ
LYEDEVRELEEALRRGQESRLQAEEETRLCAQEAEALRREALGLEQLRAR
LEDALLRMREEYGIQAEERQRAIDCLEDEKATLTLAMADWLRDYQDLLQV
KTGLSLEVATYRALLEGESNPEIVIWAEHVENMPSEFRNKSYHYTDSLLQ
RENERNLFSRQKAPLASFNHSSALYSNLSGHRGSQTGTSIGGDARRGFLG
SGYSSSATTQQENSYGKAVSSQTNVRTFSPTYGLLRNTEAQVKTFPDRPK
AGDTREVPVYIGEDSTIARESYRDRRDKVAAGASESTRSNERTVILGKKT
EVKATREQERNRPETIRTKPEEKMFDSKEKASEERNLRWEELTKLDKEAR
QRESQQMKEKAKEKDSPKEKSVREREVPISLEVSQDRRAEVSPKGLQTPV
KDAGGGTGREAEARELRFRLGTSDATGSLQGDSMTETVAENIVTSILKQF
TQSPETEASADSFPDTKVTYVDRKELPGERKTKTEIVVESKLTEDVDVSD
EAGLDYLLSKDIKEVGLKGKSAEQMIGDIINLGLKGREGRAKVVNVEIVE
EPVSYVSGEKPEEFSVPFKVEEVEDVSPGPWGLVKEEEGYGESDVTFSVN
QHRRTKQPQENTTHVEEVTEAGDSEGEQSYFVSTPDEHPGGHDRDDGSVY
GQIHIEEESTIRYSWQDEIVQGTRRRTQKDGAVGEKVVKPLDVPAPSLEG
DLGSTHWKEQARSGEFHAEPTVIEKEIKIPHEFHTSMKGISSKEPRQQLV
EVIGQLEETLPERMREELSALTREGQGGPGSVSVDVKKVQGAGGSSVTLV
AEVNVSQTVDADRLDLEELSKDEASEMEKAVESVVRESLSRQRSPAPGSP
DEEGGAEAPAAGIRFRRWATRELYIPSGESEVAGGASHSSGQRTPQGPVS
ATVEVSSPTGFAQSQVLEDVSQAARHIKLGPSEVWRTERMSYEGPTAEVV
EVSAGGDLSQAASPTGASRSVRHVTLGPGQSPLSREVIFLGPAPACPEAW
GSPEPGPAESSADMDGSGRHSTFGCRQFHAEKEIIFQGPISAAGKVGDYF
ATEESVGTQTSVRQLQLGPKEGFSGQIQFTAPLSDKVELGVIGDSVHMEG
LPGSSTSIRHISIGPQRHQTTQQIVYHGLVPQLGESGDSESTVHGEGSAD
VHQATHSHTSGRQTVMTEKSTFQSVVSESPQEDSAGDTSGAEMTSGVSRS
FRHIRLGPTETETSEHIAIRGPVSRTFVLAGSADSPELGKLADSSRTLRH
IAPGPKETSFTFQMDVSNVEAIRSRTQEAGALGVSDRGSWRDADSRNDQA
VGVSFKASAGEGDQAHREQGKEQAMFDKKVQLQRMVDQRSVISDEKKVAL
LYLDNEEEENDGHWF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, проміжних філаментах.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bhosle R.C., Michele D.E., Campbell K.P., Li Z., Robson R.M. (2006). Interactions of intermediate filament protein synemin with dystrophin and utrophin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 768 — 777.  PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.192
  • Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Human alpha-synemin interacts directly with vinculin and metavinculin.. Biochem. J. 409: 657 — 667.  PubMed DOI:10.1042/BJ20071188
  • Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Identification of a repeated domain within mammalian alpha-synemin that interacts directly with talin.. Exp. Cell Res. 314: 1839 — 1849.  PubMed DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.034
  • Mizuno Y., Puca A.A., O'Brien K.F., Beggs A.H., Kunkel L.M. (2001). Genomic organization and single-nucleotide polymorphism map of desmuslin, a novel intermediate filament protein on chromosome 15q26.3.. BMC Genet. 2: 8 — 8.  PubMed DOI:10.1186/1471-2156-2-8

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24466 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017. 
  4. UniProt, O15061 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]