SPTA1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SPTA1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SPTA1, EL2, HPP, HS3, SPH3, SPTA, Spectrin, alpha 1, spectrin alpha, erythrocytic 1
Зовнішні ІД OMIM: 182860 MGI: 98385 HomoloGene: 74460 GeneCards: SPTA1
Пов'язані генетичні захворювання
hereditary spherocytosis type 3, hereditary pyropoikilocytosis[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_003126
NM_011465
RefSeq (білок)
NP_003117
NP_035595
Локус (UCSC) Хр. 1: 158.61 – 158.69 Mb Хр. 1: 174 – 174.08 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPTA1 (англ. Spectrin alpha, erythrocytic 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 419 амінокислот, а молекулярна маса — 280 014[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQFPKETVVESSGPKVLETAEEIQERRQEVLTRYQSFKERVAERGQKLE
DSYHLQVFKRDADDLGKWIMEKVNILTDKSYEDPTNIQGKYQKHQSLEAE
VQTKSRLMSELEKTREERFTMGHSAHEETKAHIEELRHLWDLLLELTLEK
GDQLLRALKFQQYVQECADILEWIGDKEAIATSVELGEDWERTEVLHKKF
EDFQVELVAKEGRVVEVNQYANECAEENHPDLPLIQSKQNEVNAAWERLR
GLALQRQKALSNAANLQRFKRDVTEAIQWIKEKEPVLTSEDYGKDLVASE
GLFHSHKGLERNLAVMSDKVKELCAKAEKLTLSHPSDAPQIQEMKEDLVS
SWEHIRALATSRYEKLQATYWYHRFSSDFDELSGWMNEKTAAINADELPT
DVAGGEVLLDRHQQHKHEIDSYDDRFQSADETGQDLVNANHEASDEVREK
MEILDNNWTALLELWDERHRQYEQCLDFHLFYRDSEQVDSWMSRQEAFLE
NEDLGNSLGSAEALLQKHEDFEEAFTAQEEKIITVDKTATKLIGDDHYDS
ENIKAIRDGLLARRDALREKAATRRRLLKESLLLQKLYEDSDDLKNWINK
KKKLADDEDYKDIQNLKSRVQKQQVFEKELAVNKTQLENIQKTGQEMIEG
GHYASDNVTTRLSEVASLWEELLEATKQKGTQLHEANQQLQFENNAEDLQ
RWLEDVEWQVTSEDYGKGLAEVQNRLRKHGLLESAVAARQDQVDILTDLA
AYFEEIGHPDSKDIRARQESLVCRFEALKEPLATRKKKLLDLLHLQLICR
DTEDEEAWIQETEPSATSTYLGKDLIASKKLLNRHRVILENIASHEPRIQ
EITERGNKMVEEGHFAAEDVASRVKSLNQNMESLRARAARRQNDLEANVQ
FQQYLADLHEAETWIREKEPIVDNTNYGADEEAAGALLKKHEAFLLDLNS
FGDSMKALRNQANACQQQQAAPVEGVAGEQRVMALYDFQARSPREVTMKK
GDVLTLLSSINKDWWKVEAADHQGIVPAVYVRRLAHDEFPMLPQRRREEP
GNITQRQEQIENQYRSLLDRAEERRRRLLQRYNEFLLAYEAGDMLEWIQE
KKAENTGVELDDVWELQKKFDEFQKDLNTNEPRLRDINKVADDLLFEGLL
TPEGAQIRQELNSRWGSLQRLADEQRQLLGSAHAVEVFHREADDTKEQIE
KKCQALSAADPGSDLFSVQALQRRHEGFERDLVPLGDKVTILGETAERLS
ESHPDATEDLQRQKMELNEAWEDLQGRTKDRKESLNEAQKFYLFLSKARD
LQNWISSIGGMVSSQELAEDLTGIEILLERHQEHRADMEAEAPTFQALED
FSAELIDSGHHASPEIEKKLQAVKLERDDLEKAWEKRKKILDQCLELQMF
QGNCDQVESWMVARENSLRSDDKSSLDSLEALMKKRDDLDKAITAQEGKI
TDLEHFAESLIADEHYAKEEIATRLQRVLDRWKALKAQLIDERTKLGDYA
NLKQFYRDLEELEEWISEMLPTACDESYKDATNIQRKYLKHQTFAHEVDG
RSEQVHGVINLGNSLIECSACDGNEEAMKEQLEQLKEHWDHLLERTNDKG
KKLNEASRQQRFNTSIRDFEFWLSEAETLLAMKDQARDLASAGNLLKKHQ
LLEREMLAREDALKDLNTLAEDLLSSGTFNVDQIVKKKDNVNKRFLNVQE
LAAAHHEKLKEAYALFQFFQDLDDEESWIEEKLIRVSSQDYGRDLQGVQN
LLKKHKRLEGELVAHEPAIQNVLDMAEKLKDKAAVGQEEIQLRLAQFVEH
WEKLKELAKARGLKLEESLEYLQFMQNAEEEEAWINEKNALAVRGDCGDT
LAATQSLLMKHEALENDFAVHETRVQNVCAQGEDILNKVLQEESQNKEIS
SKIEALNEKTPSLAKAIAAWKLQLEDDYAFQEFNWKADVVEAWIADKETS
LKTNGNGADLGDFLTLLAKQDTLDASLQSFQQERLPEITDLKDKLISAQH
NQSKAIEERYAALLKRWEQLLEASAVHRQKLLEKQLPLQKAEDLFVEFAH
KASALNNWCEKMEENLSEPVHCVSLNEIRQLQKDHEDFLASLARAQADFK
CLLELDQQIKALGVPSSPYTWLTVEVLERTWKHLSDIIEEREQELQKEEA
RQVKNFEMCQEFEQNASTFLQWILETRAYFLDGSLLKETGTLESQLEANK
RKQKEIQAMKRQLTKIVDLGDNLEDALILDIKYSTIGLAQQWDQLYQLGL
RMQHNLEQQIQAKDIKGVSEETLKEFSTIYKHFDENLTGRLTHKEFRSCL
RGLNYYLPMVEEDEHEPKFEKFLDAVDPGRKGYVSLEDYTAFLIDKESEN
IKSSDEIENAFQALAEGKSYITKEDMKQALTPEQVSFCATHMQQYMDPRG
RSHLSGYDYVGFTNSYFGN

Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

[ред. | ред. код]
  • Linnenbach A.J., Speicher D.W., Marchesi V.T., Forget B.G. (1986). Cloning of a portion of the chromosomal gene for human erythrocyte alpha-spectrin by using a synthetic gene fragment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2397—2401. PMID 3458204 DOI:10.1073/pnas.83.8.2397
  • Speicher D.W., Marchesi V.T. (1984). Erythrocyte spectrin is comprised of many homologous triple helical segments. Nature. 311: 177—180. PMID 6472478 DOI:10.1038/311177a0
  • Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
  • Park S., Caffrey M.S., Johnson M.E., Fung L.W.-M. (2003). Solution structural studies on human erythrocyte alpha-spectrin tetramerization site. J. Biol. Chem. 278: 21837—21844. PMID 12672815 DOI:10.1074/jbc.M300617200
  • Maillet P., Alloisio N., Morle L., Delaunay J. (1996). Spectrin mutations in hereditary elliptocytosis and hereditary spherocytosis. Hum. Mutat. 8: 97—107. PMID 8844207 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1996)8:2<97::AID-HUMU1>3.3.CO;2-W
  • Speicher D.W., Davis G., Marchesi V.T. (1983). Structure of human erythrocyte spectrin. II. The sequence of the alpha-I domain. J. Biol. Chem. 258: 14938—14947. PMID 6654896

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з SPTA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11272 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P02549 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]