SPTBN4

SPTBN4
Ідентифікатори
Символи	SPTBN4, QV, SPNB4, SPTBN3, spectrin beta, non-erythrocytic 4, CMND, NEDHND
Зовнішні ІД	OMIM: 606214 MGI: 1890574 HomoloGene: 11879 GeneCards: SPTBN4
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatase binding • spectrin binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ankyrin binding • actin binding • phospholipid binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • PML body • spectrin • мембрана • cell body fiber • nuclear matrix • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • node of Ranvier • аксон • neuronal cell body • cell cortex • аксонний горбик • axon initial segment • paranode region of axon • екзосома • Цитоскелет • intercalated disc Біологічний процес • clustering of voltage-gated sodium channels • аксоноґенеза • regulation of sodium ion transport • transmission of nerve impulse • sensory perception of sound • negative regulation of heart rate • MAPK cascade • axon guidance • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • reproductive process • adult behavior • cardiac conduction • regulation of peptidyl-serine phosphorylation • actin filament capping • positive regulation of multicellular organism growth • запліднення • central nervous system projection neuron axonogenesis • vesicle-mediated transport • adult walking behavior • protein localization to plasma membrane • regulation of molecular function • cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57731	80297
Ensembl	ENSG00000160460	ENSMUSG00000011751
UniProt	Q9H254	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020971 NM_025213	NM_001199234 NM_001199235 NM_001199236 NM_032610
RefSeq (білок)	NP_066022 NP_079489	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 40.47 – 40.58 Mb	Хр. 7: 27.06 – 27.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPTBN4 (англ. Spectrin beta, non-erythrocytic 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 564 амінокислот, а молекулярна маса — 288 985.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQVPGEVDN		MEGLPAPNNN		PAARWESPDR		GWEREQPAAS		TAAASLFECS
RIKALADERE		AVQKKTFTKW		VNSHLARVGC		HIGDLYVDLR		DGFVLTRLLE
VLSGEQLPRP		TRGRMRIHSL		ENVDKALQFL		KEQRVHLENV		GSHDIVDGNH
RLTLGLVWTI		ILRFQIQVIK		IETEDNRETR		SAKDALLLWC		QMKTAGYPEV
NIQNFTTSWR		DGLAFNALIH		RHRPDLVDFS		KLTKSNANYN		LQRAFRTAEQ
HLGLARLLDP		EDVNMEAPDE		KSIITYVVSF		YHYFSKMKAL		AVEGKRIGKV
LDQVLEVGKI		IERYEELAAE		LLAWIHRTVG		LISNQKFANS		LSGVQQQLQA
FTAYCTLEKP		VKFQEKGNLE		VLLFSIQSKL		RACNRRLFVP		REGCGIWDID
KAWGELEKAE		HEREAALRAE		LIRQEKLELL		AQRFDHKVAM		RESWLNENQR
LVSQDNFGYE		LPAVEAAMKK		HEAIEADIAA		YEERVQGVAE		LAQALAAEGY
YDIRRVAAQR		DSVLRQWALL		TGLVGARRTR		LEQNLALQKV		FQEMVYMVDW
MEEMQAQLLS		RECGQHLVEA		DDLLQKHGLL		EGDIAAQSER		VEALNAAALR
FSQLQGYQPC		DPQVICNRVN		HVHGCLAELQ		EQAARRRAEL		EASRSLWALL
QELEEAESWA		RDKERLLEAA		GGGGAAGAAG		AAGTAGGAHD		LSSTARLLAQ
HKILQGELGG		RRALLQQALR		CGEELVAAGG		AVGPGADTVH		LVGLAERAAS
ARRRWQRLEE		AAARRERRLQ		EARALHQFGA		DLDGLLDWLR		DAYRLAAAGD
FGHDEASSRR		LARQHRALTG		EVEAHRGPVS		GLRRQLATLG		GASGAGPLVV
ALQVRVVEAE		QLFAEVTEVA		ALRRQWLRDA		LAVYRMFGEV		HACELWIGEK
EQWLLSMRVP		DSLDDVEVVQ		HRFESLDQEM		NSLMGRVLDV		NHTVQELVEG
GHPSSDEVRS		CQDHLNSRWN		RIVELVEQRK		EEMSAVLLVE		NHVLEVAEVR
AQVREKRRAV		ESAPRAGGAL		QWRLSGLEAA		LQALEPRQAA		LLEEAALLAE
RFPAQAARLH		QGAEELGAEW		GALASAAQAC		GEAVAAAGRL		QRFLHDLDAF
LDWLVRAQEA		AGGSEGPLPN		SLEEADALLA		RHAALKEEVD		QREEDYARIV
AASEALLAAD		GAELGPGLAL		DEWLPHLELG		WHKLLGLWEA		RREALVQAHI
YQLFLRDLRQ		ALVVLRNQEM		ALSGAELPGT		VESVEEALKQ		HRDFLTTMEL
SQQKMQVAVQ		AAEGLLRQGN		IYGEQAQEAV		TRLLEKNQEN		QLRAQQWMQK
LHDQLELQHF		LRDCHELDGW		IHEKMLMARD		GTREDNHKLH		KRWLRHQAFM
AELAQNKEWL		EKIEREGQQL		MQEKPELAAS		VRKKLGEIRQ		CWAELESTTQ
AKARQLFEAS		KADQLVQSFA		ELDKKLLHME		SQLQDVDPGG		DLATVNSQLK
KLQSMESQVE		EWYREVGELQ		AQTAALPLEP		ASKELVGERQ		NAVGERLVRL
LEPLQERRRL		LLASKELHQV		AHDLDDELAW		VQERLPLAMQ		TERGNGLQAV
QQHIKKNQGL		RREIQAHGPR		LEEVLERAGA		LASLRSPEAE		AVRRGLEQLQ
SAWAGLREAA		ERRQQVLDAA		FQVEQYYFDV		AEVEAWLGEQ		ELLMMSEDKG
KDEQSTLQLL		KKHLQLEQGV		ENYEESIAQL		SRQCRALLEM		GHPDSEQISR
RQSQVDRLYV		ALKELGEERR		VALEQQYWLY		QLSRQVSELE		HWIAEKEVVA
GSPELGQDFE		HVSVLQEKFS		EFASETGMAG		RERLAAVNQM		VDELIECGHT
AAATMAEWKD		GLNEAWAELL		ELMGTRAQLL		AASRELHKFF		SDARELQGQI
EEKRRRLPRL		TTPPEPRPSA		SSMQRTLRAF		EHDLQLLVSQ		VRQLQEGAAQ
LRTVYAGEHA		EAIASREQEV		LQGWKELLSA		CEDARLHVSS		TADALRFHSQ
VRDLLSWMDG		IASQIGAADK		PRDVSSVEVL		MNYHQGLKTE		LEARVPELTT
CQELGRSLLL		NKSAMADEIQ		AQLDKLGTRK		EEVSEKWDRH		WEWLQQMLEV
HQFAQEAVVA		DAWLTAQEPL		LQSRELGSSV		DEVEQLIRRH		EAFRKAAAAW
EERFSSLRRL		TTIEKIKAEQ		SKQPPTPLLG		RKFFGDPTEL		AAKAAPLLRP
GGYERGLEPL		ARRASDTLSA		EVRTRVGYVR		QELKPERLQP		RIDRLPEIPG
RVEPAALPAA		PEDAAETPAT		PAAAEQVRPR		PERQESADRA		EELPRRRRPE
RQESVDQSEE		AARRRRPERQ		ESAEHEAAHS		LTLGRYEQME		RRRERRERRL
ERQESSEQEM		PIRGDLVKGK		ATLADIVEQL		QEKEAGPGLP		AGPSLPQPRE
LPPGRLPNGL		ELPERTPRPD		RPRARDRPKP		RRRPRPREGG		EGGGSRRSRS
APAQGGSAPA		PPPPPTHTVQ		HEGFLLRKRE		LDANRKSSNR		SWVSLYCVLS
KGELGFYKDS		KGPASGSTHG		GEPLLSLHKA		TSEVASDYKK		KKHVFKLQTQ
DGSEFLLQAK		DEEEMNGWLE		AVASSVAEHA		EIARWGQTLP		TTSSTDEGNP
KREGGDRRAS		GRRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до кепінгів актину. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Див. також

• Хромосома 19