HMGB4

HMGB4
Ідентифікатори
Символи	HMGB4, dJ1007G16.5, high mobility group box 4
Зовнішні ІД	OMIM: 617285 MGI: 1916567 HomoloGene: 83321 GeneCards: HMGB4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • transcription factor binding • DNA binding, bending Клітинна компонента • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма Біологічний процес • activation of innate immune response • DNA recombination • ремоделювання хроматину • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signaling receptor activity • positive regulation of autophagy • GO:0007571 розвойовий процес • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of innate immune response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cell chemotaxis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	127540	69317
Ensembl	ENSG00000176256	ENSMUSG00000048686
UniProt	Q8WW32	Q6P8W9
RefSeq (мРНК)	NM_145205 NM_001352984 NM_001379301	NM_027036
RefSeq (білок)	NP_660206 NP_001339913 NP_001366230	NP_081312
Локус (UCSC)	Хр. 1: 33.86 – 33.86 Mb	Хр. 4: 128.15 – 128.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HMGB4 (англ. High mobility group box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 22 490.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKEIQLKPK		ANVSSYVHFL		LNYRNKFKEQ		QPNTYVGFKE		FSRKCSEKWR
SISKHEKAKY		EALAKLDKAR		YQEEMMNYVG		KRKKRRKRDP		QEPRRPPSSF
LLFCQDHYAQ		LKRENPNWSV		VQVAKATGKM		WSTATDLEKH		PYEQRVALLR
AKYFEELELY		RKQCNARKKY		RMSARNRCRG		KRVRQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1