Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NFE2L3
Ідентифікатори
Символи
NFE2L3 , NRF3, nuclear factor, erythroid 2 like 3, NFE2 like bZIP transcription factor 3
Зовнішні ІД
OMIM : 604135 MGI: 1339958 HomoloGene: 3168 GeneCards: NFE2L3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 26.15 – 26.19 Mb
Хр. 6: 51.41 – 51.44 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
NFE2L3 (англ. Nuclear factor, erythroid 2 like 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 694 амінокислот , а молекулярна маса — 76 154[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKHLKRWWSA GGGLLHLTLL LSLAGLRVDL DLYLLLPPPT LLQDELLFLG
GPASSAYALS PFSASGGWGR AGHLHPKGRE LDPAAPPEGQ LLREVRALGV
PFVPRTSVDA WLVHSVAAGS ADEAHGLLGA AAASSTGGAG ASVDGGSQAV
QGGGGDPRAA RSGPLDAGEE EKAPAEPTAQ VPDAGGCASE ENGVLREKHE
AVDHSSQHEE NEERVSAQKE NSLQQNDDDE NKIAEKPDWE AEKTTESRNE
RHLNGTDTSF SLEDLFQLLS SQPENSLEGI SLGDIPLPGS ISDGMNSSAH
YHVNFSQAIS QDVNLHEAIL LCPNNTFRRD PTARTSQSQE PFLQLNSHTT
NPEQTLPGTN LTGFLSPVDN HMRNLTSQDL LYDLDINIFD EINLMSLATE
DNFDPIDVSQ LFDEPDSDSG LSLDSSHNNT SVIKSNSSHS VCDEGAIGYC
TDHESSSHHD LEGAVGGYYP EPSKLCHLDQ SDSDFHGDLT FQHVFHNHTY
HLQPTAPEST SEPFPWPGKS QKIRSRYLED TDRNLSRDEQ RAKALHIPFS
VDEIVGMPVD SFNSMLSRYY LTDLQVSLIR DIRRRGKNKV AAQNCRKRKL
DIILNLEDDV CNLQAKKETL KREQAQCNKA INIMKQKLHD LYHDIFSRLR
DDQGRPVNPN HYALQCTHDG SILIVPKELV ASGHKKETQK GKRK
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші