FOXF1

FOXF1
Ідентифікатори
Символи	FOXF1, ACDMPV, FKHL5, FREAC1, forkhead box F1
Зовнішні ІД	OMIM: 601089 MGI: 1347470 HomoloGene: 1114 GeneCards: FOXF1
Пов'язані генетичні захворювання
alveolar capillary dysplasia
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро Біологічний процес • somitogenesis • regulation of smooth muscle cell differentiation • renal system development • ureter development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung morphogenesis • embryonic foregut morphogenesis • lung development • positive regulation of cell migration • endocardial cushion development • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • extracellular matrix organization • cardiac left ventricle morphogenesis • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mast cell degranulation • smooth muscle cell differentiation • morphogenesis of a branching structure • venous blood vessel development • cellular response to cytokine stimulus • right lung morphogenesis • transcription, DNA-templated • васкулогенез • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • respiratory tube development • heart development • determination of left/right symmetry • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • blood vessel development • embryonic ectodermal digestive tract morphogenesis • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • embryonic digestive tract morphogenesis • animal organ morphogenesis • pancreas development • detection of wounding • mesenchyme migration • smoothened signaling pathway • lateral mesodermal cell differentiation • lung alveolus development • digestive tract development • lung vasculature development • mesoderm development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • negative regulation of inflammatory response • lung lobe morphogenesis • ductus arteriosus closure • embryonic digestive tract development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development • midgut development • positive regulation of cell-substrate adhesion • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • cell-cell adhesion • trachea development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2294	15227
Ensembl	ENSG00000103241	ENSMUSG00000042812
UniProt	Q12946	Q61080
RefSeq (мРНК)	NM_001451	NM_010426
RefSeq (білок)	NP_001442	NP_034556
Локус (UCSC)	Хр. 16: 86.51 – 86.52 Mb	Хр. 8: 121.81 – 121.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXF1 (англ. Forkhead box F1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 40 122.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSAPEKQQP		PHGGGGGGGG		GGGAAMDPAS		SGPSKAKKTN		AGIRRPEKPP
YSYIALIVMA		IQSSPTKRLT		LSEIYQFLQS		RFPFFRGSYQ		GWKNSVRHNL
SLNECFIKLP		KGLGRPGKGH		YWTIDPASEF		MFEEGSFRRR		PRGFRRKCQA
LKPMYSMMNG		LGFNHLPDTY		GFQGSAGGLS		CPPNSLALEG		GLGMMNGHLP
GNVDGMALPS		HSVPHLPSNG		GHSYMGGCGG		AAAGEYPHHD		SSVPASPLLP
TGAGGVMEPH		AVYSGSAAAW		PPSASAALNS		GASYIKQQPL		SPCNPAANPL
SGSLSTHSLE		QPYLHQNSHN		APAELQGIPR		YHSQSPSMCD		RKEFVFSFNA
MASSSMHSAG		GGSYYHQQVT		YQDIKPCVM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hellqvist M., Mahlapuu M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1996). Differential activation of lung-specific genes by two forkhead proteins, FREAC-1 and FREAC-2. J. Biol. Chem. 271: 4482—4490. PMID 8626802 DOI:10.1074/jbc.271.8.4482
• Mahlapuu M., Pelto-Huikko M., Aitola M., Enerbaeck S., Carlsson P. (1998). FREAC-1 contains a cell-type-specific transcriptional activation domain and is expressed in epithelial-mesenchymal interfaces. Dev. Biol. 202: 183—195. PMID 9769171 DOI:10.1006/dbio.1998.9010
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Див. також

• Хромосома 16