SIX4

SIX4
Ідентифікатори
Символи	SIX4, AREC3, SIX homeobox 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606342 MGI: 106034 HomoloGene: 69089 GeneCards: SIX4
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • tongue development • trigeminal ganglion development • sarcomere organization • generation of neurons • regulation of branch elongation involved in ureteric bud branching • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • negative regulation of satellite cell differentiation • pharyngeal system development • anatomical structure morphogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • inner ear morphogenesis • myotome development • fungiform papilla morphogenesis • skeletal muscle fiber differentiation • positive regulation of ureteric bud formation • регуляція експресії генів • embryonic cranial skeleton morphogenesis • GO:1903374 anatomical structure development • regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction • olfactory placode formation • myoblast migration • thymus development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of epithelial cell proliferation • metanephric mesenchyme development • male sex determination • skeletal muscle tissue development • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • regulation of protein localization • male sex differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • male gonad development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein localization to nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51804	20474
Ensembl	ENSG00000100625	ENSMUSG00000034460
UniProt	Q9UIU6	Q61321
RefSeq (мРНК)	NM_017420	NM_011382 NM_001362272
RefSeq (білок)	NP_059116	NP_035512 NP_001349201
Локус (UCSC)	Хр. 14: 60.71 – 60.72 Mb	Хр. 12: 73.15 – 73.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIX4 (англ. SIX homeobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 82 933.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSSPTGQI		ASAADIKQEN		GMESASEGQE		AHREVAGGAA		VGLSPPAPAP
FPLEPGDAAT		AAARVSGEEG		AVAAAAAGAA		ADQVQLHSEL		LGRHHHAAAA
AAQTPLAFSP		DHVACVCEAL		QQGGNLDRLA		RFLWSLPQSD		LLRGNESLLK
ARALVAFHQG		IYPELYSILE		SHSFESANHP		LLQQLWYKAR		YTEAERARGR
PLGAVDKYRL		RRKFPLPRTI		WDGEETVYCF		KEKSRNALKE		LYKQNRYPSP
AEKRHLAKIT		GLSLTQVSNW		FKNRRQRDRN		PSETQSKSES		DGNPSTEDES
SKGHEDLSPH		PLSSSSDGIT		NLSLSSHMEP		VYMQQIGNAK		ISLSSSGVLL
NGSLVPASTS		PVFLNGNSFI		QGPSGVILNG		LNVGNTQAVA		LNPPKMSSNI
VSNGISMTDI		LGSTSQDVKE		FKVLQSSANS		ATTTSYSPSV		PVSFPGLIPS
TEVKREGIQT		VASQDGGSVV		TFTTPVQINQ		YGIVQIPNSG		ANSQFLNGSI
GFSPLQLPPV		SVAASQGNIS		VSSSTSDGST		FTSESTTVQQ		GKVFLSSLAP
SAVVYTVPNT		GQTIGSVKQE		GLERSLVFSQ		LMPVNQNAQV		NANLSSENIS
GSGLHPLASS		LVNVSPTHNF		SLSPSTLLNP		TELNRDIADS		QPMSAPVASK
STVTSVSNTN		YATLQNCSLI		TGQDLLSVPM		TQAALGEIVP		TAEDQVGHPS
PAVHQDFVQE		HRLVLQSVAN		MKENFLSNSE		SKATSSLMML		DSKSKYVLDG
MVDTVCEDLE		TDKKELAKLQ		TVQLDEDMQD		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14