GTF2E2

GTF2E2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D8J, 1D8K, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2E2, FE, TF2E2, TFIIE-B, TTD6, general transcription factor IIE subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 189964 MGI: 1915403 HomoloGene: 37573 GeneCards: GTF2E2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • TFIIH-class transcription factor complex binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription factor TFIIE complex • Нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2961	68153
Ensembl	ENSG00000197265	ENSMUSG00000031585
UniProt	P29084	Q9D902
RefSeq (мРНК)	NM_002095 NM_001348353	NM_001167921 NM_001167922 NM_026584
RefSeq (білок)	NP_002086 NP_001335282	NP_001161393 NP_001161394 NP_080860
Локус (UCSC)	Хр. 8: 30.58 – 30.66 Mb	Хр. 8: 34.22 – 34.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2E2 (англ. General transcription factor IIE subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 33 044.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPSLLRERE		LFKKRALSTP		VVEKRSASSE		SSSSSSKKKK		TKVEHGGSSG
SKQNSDHSNG		SFNLKALSGS		SGYKFGVLAK		IVNYMKTRHQ		RGDTHPLTLD
EILDETQHLD		IGLKQKQWLM		TEALVNNPKI		EVIDGKYAFK		PKYNVRDKKA
LLRLLDQHDQ		RGLGGILLED		IEEALPNSQK		AVKALGDQIL		FVNRPDKKKI
LFFNDKSCQF		SVDEEFQKLW		RSVTVDSMDE		EKIEEYLKRQ		GISSMQESGP
KKVAPIQRRK		KPASQKKRRF		KTHNEHLAGV		LKDYSDITSS		K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kang S.-W., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2000). Functional interaction of general transcription initiation factor TFIIE with general chromatin factor SPT16/CDC68. Genes Cells. 5: 251—263. PMID 10792464 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00323.x

Див. також

• Хромосома 8