RUNX1T1

RUNX1T1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WQ6, 2DJ8, 2H7B, 2KYG, 2OD1, 2ODD, 2PP4, 4JOL
Ідентифікатори
Символи	RUNX1T1, AML1T1, CBFA2T1, CDR, ETO, MTG8, ZMYND2, AML1-MTG8, t(8;21)(q22;q22), RUNX1 translocation partner 1, RUNX1 partner transcriptional co-repressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 133435 MGI: 104793 HomoloGene: 3801 GeneCards: RUNX1T1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• nuclear matrix; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of fat cell differentiation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • generation of precursor metabolites and energy; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	862
	12395
	ENSG00000079102
	ENSMUSG00000006586
	Q06455
	Q61909
NM_001198625; NM_001198626; NM_001198627; NM_001198628; NM_001198629;
	NM_001198630; NM_001198631; NM_001198632; NM_001198633; NM_001198634; NM_001198679; NM_004349; NM_175634; NM_175635; NM_175636; NM_001395209
	NM_001111026; NM_001111027; NM_009822
NP_001185554; NP_001185555; NP_001185556; NP_001185557; NP_001185558;
	NP_001185559; NP_001185560; NP_001185561; NP_001185562; NP_001185563; NP_001185608; NP_004340; NP_783552; NP_783553; NP_783554; NP_783553.1; NP_783554.1
	NP_001104496; NP_001104497; NP_033952
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RUNX1T1 (англ. RUNX1 translocation partner 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 604 амінокислот, а молекулярна маса — 67 566^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MISVKRNTWR	ALSLVIGDCR	KKGNFEYCQD	RTEKHSTMPD	SPVDVKTQSR
LTPPTMPPPP	TTQGAPRTSS	FTPTTLTNGT	SHSPTALNGA	PSPPNGFSNG
PSSSSSSSLA	NQQLPPACGA	RQLSKLKRFL	TTLQQFGNDI	SPEIGERVRT
LVLGLVNSTL	TIEEFHSKLQ	EATNFPLRPF	VIPFLKANLP	LLQRELLHCA
RLAKQNPAQY	LAQHEQLLLD	ASTTSPVDSS	ELLLDVNENG	KRRTPDRTKE
NGFDREPLHS	EHPSKRPCTI	SPGQRYSPNN	GLSYQPNGLP	HPTPPPPQHY
RLDDMAIAHH	YRDSYRHPSH	RDLRDRNRPM	GLHGTRQEEM	IDHRLTDREW
AEEWKHLDHL	LNCIMDMVEK	TRRSLTVLRR	CQEADREELN	YWIRRYSDAE
DLKKGGGSSS	SHSRQQSPVN	PDPVALDAHR	EFLHRPASGY	VPEEIWKKAE
EAVNEVKRQA	MTELQKAVSE	AERKAHDMIT	TERAKMERTV	AEAKRQAAED
ALAVINQQED	SSESCWNCGR	KASETCSGCN	TARYCGSFCQ	HKDWEKHHHI
CGQTLQAQQQ	GDTPAVSSSV	TPNSGAGSPM	DTPPAATPRS	TTPGTPSTIE
TTPR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Wolford J.K., Prochazka M. (1998). Structure and expression of the human MTG8/ETO gene. Gene. 212: 103—109. PMID 9661669 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00141-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Davis J.N., McGhee L., Meyers S. (2003). The ETO (MTG8) gene family. Gene. 303: 1—10. PMID 12559562 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01172-1
Rossetti S., Hoogeveen A.T., Sacchi N. (2004). The MTG proteins: chromatin repression players with a passion for networking. Genomics. 84: 1—9. PMID 15203199 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.02.011
Kwok C., Zeisig B.B., Qiu J., Dong S., So C.W. (2009). Transforming activity of AML1-ETO is independent of CBFbeta and ETO interaction but requires formation of homo-oligomeric complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 2853—2858. PMID 19202074 DOI:10.1073/pnas.0810558106
Plevin M.J., Zhang J., Guo C., Roeder R.G., Ikura M. (2006). The acute myeloid leukemia fusion protein AML1-ETO targets E proteins via a paired amphipathic helix-like TBP-associated factor homology domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10242—10247. PMID 16803958 DOI:10.1073/pnas.0603463103

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1535 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q06455 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1535 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q06455 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RUNX1T1

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук