GTF2F2

GTF2F2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BBY, 1F3U, 2BBY, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	GTF2F2, BTF4, RAP30, TF2F2, TFIIF, general transcription factor IIF subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 189969 MGI: 1915955 HomoloGene: 37884 GeneCards: GTF2F2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding Клітинна компонента • microtubule cytoskeleton • нуклеоплазма • transcription factor TFIIF complex • клітинне ядро • transcription preinitiation complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • positive regulation of viral transcription • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • RNA metabolic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2963	68705
Ensembl	ENSG00000188342	ENSMUSG00000067995
UniProt	P13984	Q8R0A0
RefSeq (мРНК)	NM_004128	NM_026816
RefSeq (білок)	NP_004119	NP_081092
Локус (UCSC)	Хр. 13: 45.12 – 45.28 Mb	Хр. 14: 76.13 – 76.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2F2 (англ. General transcription factor IIF subunit 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 28 380.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAERGELDLT		GAKQNTGVWL		VKVPKYLSQQ		WAKASGRGEV		GKLRIAKTQG
RTEVSFTLNE		DLANIHDIGG		KPASVSAPRE		HPFVLQSVGG		QTLTVFTESS
SDKLSLEGIV		VQRAECRPAA		SENYMRLKRL		QIEESSKPVR		LSQQLDKVVT
TNYKPVANHQ		YNIEYERKKK		EDGKRARADK		QHVLDMLFSA		FEKHQYYNLK
DLVDITKQPV		VYLKEILKEI		GVQNVKGIHK		NTWELKPEYR		HYQGEEKSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Sopta M., Burton Z.F., Greenblatt J. (1989). Structure and associated DNA-helicase activity of a general transcription initiation factor that binds to RNA polymerase II. Nature. 341: 410—414. PMID 2477704 DOI:10.1038/341410a0
• Horikoshi M., Fujita H., Wang J., Takada R., Roeder R.G. (1991). Nucleotide and amino acid sequence of RAP30. Nucleic Acids Res. 19: 5436—5436. PMID 1840667 DOI:10.1093/nar/19.19.5436
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
• Groft C.M., Uljon S.N., Wang R., Werner M.H. (1998). Structural homology between the Rap30 DNA-binding domain and linker histone H5: implications for preinitiation complex assembly. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9117—9122. PMID 9689043 DOI:10.1073/pnas.95.16.9117

Див. також

• Хромосома 13