HOXA5

HOXA5
Ідентифікатори
Символи	HOXA5, HOX1, HOX1.3, HOX1C, homeobox A5
Зовнішні ІД	OMIM: 142952 MGI: 96177 HomoloGene: 40726 GeneCards: HOXA5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • pattern specification process • skeletal system development • respiratory system process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism growth • lung development • trachea morphogenesis • bronchiole development • cell-cell signaling involved in mammary gland development • regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • mammary gland alveolus development • lung goblet cell differentiation • transcription, DNA-templated • mammary gland epithelial cell differentiation • negative regulation of erythrocyte differentiation • respiratory gaseous exchange by respiratory system • trachea cartilage morphogenesis • embryonic skeletal system development • morphogenesis of an epithelium • multicellular organism development • thyroid gland development • lobar bronchus epithelium development • mesenchymal-epithelial cell signaling • positive regulation of apoptotic process • intestinal epithelial cell maturation • negative regulation of angiogenesis • cartilage morphogenesis • lung alveolus development • lung-associated mesenchyme development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • cell migration • positive regulation of myeloid cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3202	15402
Ensembl	ENSG00000106004	ENSMUSG00000038253
UniProt	P20719	P09021
RefSeq (мРНК)	NM_019102	NM_010453
RefSeq (білок)	NP_061975	NP_034583
Локус (UCSC)	Хр. 7: 27.14 – 27.14 Mb	Хр. 6: 52.18 – 52.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXA5 (англ. Homeobox A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 345.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNSFC		GRYPNGPDYQ		LHNYGDHSSV		SEQFRDSASM		HSGRYGYGYN
GMDLSVGRSG		SGHFGSGERA		RSYAASASAA		PAEPRYSQPA		TSTHSPQPDP
LPCSAVAPSP		GSDSHHGGKN		SLSNSSGASA		DAGSTHISSR		EGVGTASGAE
EDAPASSEQA		SAQSEPSPAP		PAQPQIYPWM		RKLHISHDNI		GGPEGKRART
AYTRYQTLEL		EKEFHFNRYL		TRRRRIEIAH		ALCLSERQIK		IWFQNRRMKW
KKDNKLKSMS		MAAAGGAFRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Tournier-Lasserve E., Odenwald W.F., Garbern J., Trojanowski J., Lazzarini R.A. (1989). Remarkable intron and exon sequence conservation in human and mouse homeobox Hox 1.3 genes. Mol. Cell. Biol. 9: 2273—2278. PMID 2568583 DOI:10.1128/MCB.9.5.2273
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7