Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXC10
Ідентифікатори
Символи
HOXC10 , HOX3I, homeobox C10
Зовнішні ІД
OMIM : 605560 MGI: 96192 HomoloGene: 9680 GeneCards: HOXC10
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex • клітинне ядро • Ядерні тільця • Нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • neuromuscular process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic limb morphogenesis • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • anterior/posterior pattern specification • spinal cord motor neuron cell fate specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 53.99 – 53.99 Mb
Хр. 15: 102.88 – 102.88 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HOXC10 (англ. Homeobox C10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот , а молекулярна маса — 38 073[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTCPRNVTPN SYAEPLAAPG GGERYSRSAG MYMQSGSDFN CGVMRGCGLA
PSLSKRDEGS SPSLALNTYP SYLSQLDSWG DPKAAYRLEQ PVGRPLSSCS
YPPSVKEENV CCMYSAEKRA KSGPEAALYS HPLPESCLGE HEVPVPSYYR
ASPSYSALDK TPHCSGANDF EAPFEQRASL NPRAEHLESP QLGGKVSFPE
TPKSDSQTPS PNEIKTEQSL AGPKGSPSES EKERAKAADS SPDTSDNEAK
EEIKAENTTG NWLTAKSGRK KRCPYTKHQT LELEKEFLFN MYLTRERRLE
ISKTINLTDR QVKIWFQNRR MKLKKMNREN RIRELTSNFN FT
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Flagiello D., Gibaud A., Dutrillaux B., Poupon M.-F., Malfoy B. (1997). Distinct patterns of all-trans retinoic acid dependent expression of HOXB and HOXC homeogenes in human embryonal and small-cell lung carcinoma cell lines. FEBS Lett . 415 : 263—267. PMID 9357979 DOI :10.1016/S0014-5793(97)01118-6
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші