HOXC10

HOXC10
Ідентифікатори
Символи	HOXC10, HOX3I, homeobox C10
Зовнішні ІД	OMIM: 605560 MGI: 96192 HomoloGene: 9680 GeneCards: HOXC10
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex • клітинне ядро • ядерні тільця • нуклеоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • neuromuscular process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic limb morphogenesis • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • anterior/posterior pattern specification • spinal cord motor neuron cell fate specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3226	209448
Ensembl	ENSG00000180818	ENSMUSG00000022484
UniProt	Q9NYD6	P31257
RefSeq (мРНК)	NM_017409	NM_010462
RefSeq (білок)	NP_059105	NP_034592
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.99 – 53.99 Mb	Хр. 15: 102.88 – 102.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXC10 (англ. Homeobox C10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 38 073.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTCPRNVTPN		SYAEPLAAPG		GGERYSRSAG		MYMQSGSDFN		CGVMRGCGLA
PSLSKRDEGS		SPSLALNTYP		SYLSQLDSWG		DPKAAYRLEQ		PVGRPLSSCS
YPPSVKEENV		CCMYSAEKRA		KSGPEAALYS		HPLPESCLGE		HEVPVPSYYR
ASPSYSALDK		TPHCSGANDF		EAPFEQRASL		NPRAEHLESP		QLGGKVSFPE
TPKSDSQTPS		PNEIKTEQSL		AGPKGSPSES		EKERAKAADS		SPDTSDNEAK
EEIKAENTTG		NWLTAKSGRK		KRCPYTKHQT		LELEKEFLFN		MYLTRERRLE
ISKTINLTDR		QVKIWFQNRR		MKLKKMNREN		RIRELTSNFN		FT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Flagiello D., Gibaud A., Dutrillaux B., Poupon M.-F., Malfoy B. (1997). Distinct patterns of all-trans retinoic acid dependent expression of HOXB and HOXC homeogenes in human embryonal and small-cell lung carcinoma cell lines. FEBS Lett. 415: 263—267. PMID 9357979 DOI:10.1016/S0014-5793(97)01118-6
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 12