NPAS1

NPAS1
Ідентифікатори
Символи	NPAS1, MOP5, PASD5, bHLHe11, neuronal PAS domain protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603346 MGI: 109205 HomoloGene: 1886 GeneCards: NPAS1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • central nervous system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • переляк • maternal behavior • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4861	18142
Ensembl	ENSG00000130751	ENSMUSG00000001988
UniProt	Q99742	P97459
RefSeq (мРНК)	NM_002517 NM_001321086	NM_008718
RefSeq (білок)	NP_001308015 NP_002508	NP_032744
Локус (UCSC)	Хр. 19: 47.02 – 47.05 Mb	Хр. 7: 16.19 – 16.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NPAS1 (англ. Neuronal PAS domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 62 702.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPYPGSGG		GSEVKCVGGR		GASVPWDFLP		GLMVKAPSGP		CLQAQRKEKS
RNAARSRRGK		ENLEFFELAK		LLPLPGAISS		QLDKASIVRL		SVTYLRLRRF
AALGAPPWGL		RAAGPPAGLA		PGRRGPAALV		SEVFEQHLGG		HILQSLDGFV
FALNQEGKFL		YISETVSIYL		GLSQVEMTGS		SVFDYIHPGD		HSEVLEQLGL
RTPTPGPPTP		PSVSSSSSSS		SSLADTPEIE		ASLTKVPPSS		LVQERSFFVR
MKSTLTKRGL		HVKASGYKVI		HVTGRLRAHA		LGLVALGHTL		PPAPLAELPL
HGHMIVFRLS		LGLTILACES		RVSDHMDLGP		SELVGRSCYQ		FVHGQDATRI
RQSHVDLLDK		GQVMTGYYRW		LQRAGGFVWL		QSVATVAGSG		KSPGEHHVLW
VSHVLSQAEG		GQTPLDAFQL		PASVACEEAS		SPGPEPTEPE		PPTEGKQAAP
AENEAPQTQG		KRIKVEPGPR		ETKGSEDSGD		EDPSSHPATP		RPEFTSVIRA
GVLKQDPVRP		WGLAPPGDPP		PTLLHAGFLP		PVVRGLCTPG		TIRYGPAELG
LVYPHLQRLG		PGPALPEAFY		PPLGLPYPGP		AGTRLPRKGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19