Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF318 (англ. Zinc finger protein 318 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 279 амінокислот , а молекулярна маса — 251 112[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MYRSSARSSV SSHRPKDDGG GGPRSGRSSG SSSGPARRSS PPPPPSGSSS
RTPARRPRSP SGHRGRRASP SPPRGRRVSP SPPRARRGSP SPPRGRRLFP
PGPAGFRGSS RGESRADYAR DGRGDHPGDS GSRRRSPGLC SDSLEKSLRI
TVGNDHFCVS TPERRRLSDR LGSPVDNLED MDRDDLTDDS VFTRSSQCSR
GLERYISQEE GPLSPFLGQL DEDYRTKETF LHRSDYSPHI SCHDELLRGT
ERNREKLKGY SIRSEERSRE AKRPRYDDTV KINSMGGDHP SFTSGTRNYR
QRRRSPSPRF LDPEFRELDL ARRKREEEEE RSRSLSQELV GVDGGGTGCS
IPGLSGVLTA SEPGYSLHRP EEVSVMPKKS ILKKRIEVDI MEPSMQLESF
SSSTSSSQDH PLYSGHPSLP LSGAIAAFAS EIENKGTMVE TALKEPQGNL
YQWGPLPGIP KDNSPLREKF GSFLCHKDNL DLKAEGPERH TDFLLPHERA
SQDGSGFSRI LSMLADSTST QEKRRRSFPD IEDEEKFLYG DEEEDLKAES
VPKPLGSSES EVMRQKASSL PSSAPAVKLE SLEETNPEYA KIHDLLKTIG
LDIGVAEISQ LAARTQERLH GKKPSLRSSA DRRSSVDRYF SADHCSSVDH
RFSADRCSSV DHCFSADRRS SDPHRLESRE AHHSNTHSPE VSHPHPPSPV
DPYLLTKNSP PFLKSDHPVG HISGPEVVGS GFQSSVAVRC MLPSAPSAPI
RLPHTAALSQ FHMPRASQFA AARIPPNYQG PAIPPASFDA YRHYMAYAAS
RWPMYPTSQP SNHPVPEPHR IMPITKQATR SRPNLRVIPT VTPDKPKQKE
SLRGSIPAAQ VPVQVSIPSL IRYNPEKISD EKNRASQKQK VIEEREKLKN
DREARQKKMY YLRTELERLH KQQGEMLRKK RREKDGHKDP LLVEVSRLQD
NIMKDIAELR QEAEEAEKKQ SELDKVAQIL GINIFDKSQK SLSDSREPTE
KPGKAEKSKS PEKVSSFSNS SSNKESKVNN EKFRTKSPKP AESPQSATKQ
LDQPTAAYEY YDAGNHWCKD CNTICGTMFD FFTHMHNKKH TQTLDPYNRP
WASKTQSEAK QDAIKRTDKI TVPAKGSEFL VPISGFYCQL CEEFLGDPIS
GEQHVKGHQH NEKYKKYVDE NPLYEERRNL DRQAGLAVVL ETERRRQSEL
KRKLSEKPKE EKKEKKAKAV KEVKEDDKVS EKLEDQLSEG RNSPEKAENK
RNTGIKLQLK EEVKKESPTS SSFGKFSWKK PEKEEEKSSL VTPSISKEEI
LESSKDKEDG KTEAGKAKPI KIKLSGKTVV AHTSPWMPVV TTSTQTKIRP
NLPIPSTVLR KSCSATMSKP APLNTFLSIK SSGTTAKPLP VVKESSADLL
LPPDIISKAF GGEEVILKGS PEEKVVLAEK SEPSHLPEQI LPPPPPPPPP
PPPPPPVIPH PAAPSAAQAN AILAPVKSNP VVSQTLSPGF VGPNILNPVL
PVAIMASAQP AAIPSDETAP GVSESDRDQT LFSVLVRPPP PLSSVFSEQA
KKLEKRNSCL ATANAKDLYD IFYSSGGKGA PETKGAPETK LSGGPLANGE
NSNLSRTKSS DTSSTSPLNS SASQEELHQD EGLVAAPIVS NSEKPIAKTL
VALGKWSVVE HVGPKSTGST YGFLQPLTRL CQSRPYETIT PKTDTLAIWT
SSSFQSDTSR DISPEKSELD LGEPGPPGVE PPPQLLDIQC KESQKLVEIH
LRESVNQDKE SQELRKSEDC RESEIETNTE LKERVKELSE GIVDEGVSTS
IGPHSIDDSN LNHGNRYMWE GEVKQPNLLM IDKEAEQSNK LMTGSETPSK
VVIKLSPQAC SFTKAKLDSF LSEARSLLNP QDTPVKISAP ELLLHSPARS
AMCLTGSPQE QGVSVVSEEG LENSAPESAS RTSRYRSLKL KRERSKDFQV
KKIYELAVWD ENKKRPETWE SPEKPKTEAL ELQDVHPELT VTIESKALED
FEATDLKVEE LTALGNLGDM PVDFCTTRVS PAHRSPTVLC QKVCEENSVS
PIGCNSSDPA DFEPIPSFSG FPLDSPKTLV LDFETEGERN SPNPRSVRIP
SPNILKTGLT ENVDRGLGGL EGTHQALDLL AGGMMPEEVK ESSQLDKQES
LGLELKTINS AGLGPSPCLP DLVDFVTRTS GVQKDKLCSP LSEPGDPSKC
SSLELGPLQL EISNASTTEV AILQVDDDSG DPLNLVKAPV SRSPPREQVI
EDNMVPQGMP EQETTVGAIQ DHTESSVHN
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , мейоз , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші