FOXG1

FOXG1
Ідентифікатори
Символи	FOXG1, BF1, BF2, FHKL3, FKH2, FKHL1, FKHL2, FKHL3, FKHL4, FOXG1A, FOXG1B, FOXG1C, HBF-1, HBF-2, HBF-3, HBF-G2, HBF2, HFK1, HFK2, HFK3, KHL2, QIN, forkhead box G1
Зовнішні ІД	OMIM: 164874 MGI: 1347464 HomoloGene: 3843 GeneCards: FOXG1
Пов'язані генетичні захворювання
синдром Ретта
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0010260 старіння людини • brain development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuroblast proliferation • regulation of mitotic cell cycle • dorsal/ventral pattern formation • регуляція експресії генів • axon midline choice point recognition • pyramidal neuron migration to cerebral cortex • central nervous system neuron development • cerebral cortex development • Нейрогенез • forebrain development • inner ear morphogenesis • negative regulation of neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell cycle • neuron fate determination • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • regulation of cell cycle • regulation of neural precursor cell proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2290	15228
Ensembl	ENSG00000176165	ENSMUSG00000020950
UniProt	P55316	Q60987
RefSeq (мРНК)	NM_005249	NM_001160112 NM_008241
RefSeq (білок)	NP_005240	NP_001153584 NP_032267
Локус (UCSC)	Хр. 14: 28.77 – 28.77 Mb	Хр. 12: 49.43 – 49.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXG1 (англ. Forkhead box G1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 52 352.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLDMGDRKEV		KMIPKSSFSI		NSLVPEAVQN		DNHHASHGHH		NSHHPQHHHH
HHHHHHHPPP		PAPQPPPPPQ		QQQPPPPPPP		APQPPQTRGA		PAADDDKGPQ
QLLLPPPPPP		PPAAALDGAK		ADGLGGKGEP		GGGPGELAPV		GPDEKEKGAG
AGGEEKKGAG		EGGKDGEGGK		EGEKKNGKYE		KPPFSYNALI		MMAIRQSPEK
RLTLNGIYEF		IMKNFPYYRE		NKQGWQNSIR		HNLSLNKCFV		KVPRHYDDPG
KGNYWMLDPS		SDDVFIGGTT		GKLRRRSTTS		RAKLAFKRGA		RLTSTGLTFM
DRAGSLYWPM		SPFLSLHHPR		ASSTLSYNGT		TSAYPSHPMP		YSSVLTQNSL
GNNHSFSTAN		GLSVDRLVNG		EIPYATHHLT		AAALAASVPC		GLSVPCSGTY
SLNPCSVNLL		AGQTSYFFPH		VPHPSMTSQS		STSMSARAAS		SSTSPQAPST
LPCESLRPSL		PSFTTGLSGG		LSDYFTHQNQ		GSSSNPLIH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bredenkamp N., Seoighe C., Illing N. (2007). Comparative evolutionary analysis of the FoxG1 transcription factor from diverse vertebrates identifies conserved recognition sites for microRNA regulation. Dev. Genes Evol. 217: 227—233. PMID 17260156 DOI:10.1007/s00427-006-0128-x

Див. також

• Хромосома 14