SOX17

SOX17
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YUL, 4A3N
Ідентифікатори
Символи	SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transcription factor 17
Зовнішні ІД	OMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 GeneCards: SOX17
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • beta-catenin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • renal system development • endoderm development • regulation of embryonic development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • stem cell fate specification • positive regulation of skeletal muscle tissue development • embryonic foregut morphogenesis • embryonic organ development • endodermal digestive tract morphogenesis • negative regulation of mesodermal cell fate specification • inner cell mass cellular morphogenesis • negative regulation of Wnt signaling pathway • protein stabilization • endocardium formation • outflow tract morphogenesis • signal transduction involved in regulation of gene expression • endodermal cell fate determination • mRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of mesodermal cell fate specification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway • endocardial cell differentiation • regulation of cardiac cell fate specification • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • embryonic heart tube development • васкулогенез • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • heart looping • cardiac cell fate determination • common bile duct development • negative regulation of Wnt signaling pathway involved in heart development • rostrocaudal neural tube patterning • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cardiogenic plate morphogenesis • heart formation • embryonic heart tube morphogenesis • negative regulation of cell growth • protein destabilization • Ангіогенез • Сперматогенез • positive regulation of cell differentiation • regulation of stem cell division • гаструляція • gall bladder development • canonical Wnt signaling pathway • регуляція диференціювання клітин • cell migration involved in gastrulation • endoderm formation • regulation of stem cell proliferation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to leukemia inhibitory factor • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64321	20671
Ensembl	ENSG00000164736	ENSMUSG00000025902
UniProt	Q9H6I2	Q61473
RefSeq (мРНК)	NM_022454	NM_001289464 NM_001289465 NM_001289466 NM_001289467 NM_011441
RefSeq (білок)	NP_071899	NP_001276393 NP_001276394 NP_001276395 NP_001276396 NP_035571
Локус (UCSC)	Хр. 8: 54.46 – 54.46 Mb	Хр. 1: 4.56 – 4.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX17 (англ. SRY-box 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 117.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSPDAGYAS		DDQSQTQSAL		PAVMAGLGPC		PWAESLSPIG		DMKVKGEAPA
NSGAPAGAAG		RAKGESRIRR		PMNAFMVWAK		DERKRLAQQN		PDLHNAELSK
MLGKSWKALT		LAEKRPFVEE		AERLRVQHMQ		DHPNYKYRPR		RRKQVKRLKR
VEGGFLHGLA		EPQAAALGPE		GGRVAMDGLG		LQFPEQGFPA		GPPLLPPHMG
GHYRDCQSLG		APPLDGYPLP		TPDTSPLDGV		DPDPAFFAAP		MPGDCPAAGT
YSYAQVSDYA		GPPEPPAGPM		HPRLGPEPAG		PSIPGLLAPP		SALHVYYGAM
GSPGAGGGRG		FQMQPQHQHQ		HQHQHHPPGP		GQPSPPPEAL		PCRDGTDPSQ
PAELLGEVDR		TEFEQYLHFV		CKPEMGLPYQ		GHDSGVNLPD		SHGAISSVVS
DASSAVYYCN		YPDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Katoh M. (2002). Molecular cloning and characterization of human SOX17. Int. J. Mol. Med. 9: 153—157. PMID 11786926

Див. також

• Хромосома 8