IRF1

IRF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IF1
Ідентифікатори
Символи	IRF1, IRF-1, MAR, interferon regulatory factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147575 MGI: 96590 HomoloGene: 1658 GeneCards: IRF1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0097285 апоптоз • regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation • regulation of innate immune response • negative regulation of regulatory T cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to interferon-beta • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • regulation of adaptive immune response • зсідання крові • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to mechanical stimulus • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • regulation of immune response • регуляція експресії генів • вроджений імунітет • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of interferon-beta production Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3659	16362
Ensembl	ENSG00000125347	ENSMUSG00000018899
UniProt	P10914	P15314
RefSeq (мРНК)	NM_002198	NM_001159393 NM_001159396 NM_008390
RefSeq (білок)	NP_002189 NP_001341853 NP_001341854	NP_001152865 NP_001152868 NP_032416
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 11: 53.66 – 53.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF1 (англ. Interferon regulatory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 36 502.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPITRMRMRP		WLEMQINSNQ		IPGLIWINKE		EMIFQIPWKH		AAKHGWDINK
DACLFRSWAI		HTGRYKAGEK		EPDPKTWKAN		FRCAMNSLPD		IEEVKDQSRN
KGSSAVRVYR		MLPPLTKNQR		KERKSKSSRD		AKSKAKRKSC		GDSSPDTFSD
GLSSSTLPDD		HSSYTVPGYM		QDLEVEQALT		PALSPCAVSS		TLPDWHIPVE
VVPDSTSDLY		NFQVSPMPST		SEATTDEDEE		GKLPEDIMKL		LEQSEWQPTN
VDGKGYLLNE		PGVQPTSVYG		DFSCKEEPEI		DSPGGDIGLS		LQRVFTDLKN
MDATWLDSLL		TPVRLPSIQA		IPCAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. (1989). Sequence of a cDNA coding for human IRF-1. Nucleic Acids Res. 17: 3292—3292. PMID 2726461 DOI:10.1093/nar/17.8.3292
• Cha Y., Sims S.H., Romine M.F., Kaufmann M., Deisseroth A.B. (1992). Human interferon regulatory factor 1: intron-exon organization. DNA Cell Biol. 11: 605—611. PMID 1382447 DOI:10.1089/dna.1992.11.605
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lin R., Hiscott J. (1999). A role for casein kinase II phosphorylation in the regulation of IRF-1 transcriptional activity. Mol. Cell. Biochem. 191: 169—180. PMID 10094406 DOI:10.1023/A:1006850009017
• Taniguchi T., Ogasawara K., Takaoka A., Tanaka N. (2001). IRF family of transcription factors as regulators of host defense. Annu. Rev. Immunol. 19: 623—655. PMID 11244049 DOI:10.1146/annurev.immunol.19.1.623
• Kroeger A., Koester M., Schroeder K., Hauser H., Mueller P.P. (2002). Activities of IRF-1. J. Interferon Cytokine Res. 22: 5—14. PMID 11846971 DOI:10.1089/107999002753452610

Див. також

• Хромосома 5