MYT1

MYT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JX1, 2JYD, 2MF8
Ідентифікатори
Символи	MYT1, C20orf36, MTF1, MYTI, NZF2, PLPB1, ZC2HC4A, ZC2H2C1, myelin transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600379 MGI: 1100535 HomoloGene: 3332 GeneCards: MYT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • диференціація клітин • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4661	17932
Ensembl	ENSG00000196132	ENSMUSG00000010505
UniProt	Q01538	Q8CFC2
RefSeq (мРНК)	NM_004535	NM_001171615 NM_001171616 NM_001171680 NM_008665
RefSeq (білок)	NP_004526	NP_001165086 NP_001165087 NP_001165151 NP_032691
Локус (UCSC)	Хр. 20: 64.1 – 64.24 Mb	Хр. 2: 181.76 – 181.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYT1 (англ. Myelin transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 121 амінокислот, а молекулярна маса — 122 329.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLENEDKRA		RTRSKALRGP		PETTAADLSC		PTPGCTGSGH		VRGKYSRHRS
LQSCPLAKKR		KLEGAEAEHL		VSKRKSHPLK		LALDEGYGVD		SDGSEDTEVK
DASVSDESEG		TLEGAEAETS		GQDEIHRPET		AEGRSPVKSH		FGSNPIGSAT
ASSKGSYSSY		QGIIATSLLN		LGQIAEETLV		EEDLGQAAKP		GPGIVHLLQE
AAEGAASEEG		EKGLFIQPED		AEEVVEVTTE		RSQDLCPQSL		EDAASEESSK
QKGILSHEEE		DEEEEEEEEE		EEEDEEEEEE		EEEEEEEEEE		EEEEEEEEEE
EEEEEEAAPD		VIFQEDTSHT		SAQKAPELRG		PESPSPKPEY		SVIVEVRSDD
DKDEDTHSRK		STVTDESEMQ		DMMTRGNLGL		LEQAIALKAE		QVRTVCEPGC
PPAEQSQLGL		GEPGKAAKPL		DTVRKSYYSK		DPSRAEKREI		KCPTPGCDGT
GHVTGLYPHH		RSLSGCPHKD		RIPPEILAMH		ENVLKCPTPG		CTGQGHVNSN
RNTHRSLSGC		PIAAAEKLAK		SHEKQQPQTG		DPSKSSSNSD		RILRPMCFVK
QLEVPPYGSY		RPNVAPATPR		ANLAKELEKF		SKVTFDYASF		DAQVFGKRML
APKIQTSETS		PKAFQCFDYS		QDAEAAHMAA		TAILNLSTRC		WEMPENLSTK
PQDLPSKSVD		IEVDENGTLD		LSMHKHRKRE		NAFPSSSSCS		SSPGVKSPDA
SQRHSSTSAP		SSSMTSPQSS		QASRQDEWDR		PLDYTKPSRL		REEEPEESEP
AAHSFASSEA		DDQEVSEENF		EERKYPGEVT		LTNFKLKFLS		KDIKKELLTC
PTPGCDGSGH		ITGNYASHRS		LSGCPLADKS		LRNLMAAHSA		DLKCPTPGCD
GSGHITGNYA		SHRSLSGCPR		AKKSGVKVAP		TKDDKEDPEL		MKCPVPGCVG
LGHISGKYAS		HRSASGCPLA		ARRQKEGSLN		GSSFSWKSLK		NEGPTCPTPG
CDGSGHANGS		FLTHRSLSGC		PRATFAGKKG		KLSGDEVLSP		KFKTSDVLEN
DEEIKQLNQE		IRDLNESNSE		MEAAMVQLQS		QISSMEKNLK		NIEEENKLIE
EQNEALFLEL		SGLSQALIQS		LANIRLPHME		PICEQNFDAY		VSTLTDMYSN
QDPENKDLLE		SIKQAVRGIQ		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J.G., Hudson L.D. (1992). Novel member of the zinc finger superfamily: a C2-HC finger that recognizes a glia-specific gene. Mol. Cell. Biol. 12: 5632—5639. PMID 1280325 DOI:10.1128/MCB.12.12.5632
• Armstrong R.C., Kim J.G., Hudson L.D. (1995). Expression of myelin transcription factor I (MyTI), a 'zinc-finger' DNA-binding protein, in developing oligodendrocytes. Glia. 14: 303—321. PMID 8530187 DOI:10.1002/glia.440140407
• Nielsen J.A., Berndt J.A., Hudson L.D., Armstrong R.C. (2004). Myelin transcription factor 1 (Myt1) modulates the proliferation and differentiation of oligodendrocyte lineage cells. Mol. Cell. Neurosci. 25: 111—123. PMID 14962745 DOI:10.1016/j.mcn.2003.10.001

Див. також

• Хромосома 20