HOXC6

HOXC6
Ідентифікатори
Символи	HOXC6, CP25, HHO.C8, HOX3, HOX3C, homeobox C6
Зовнішні ІД	OMIM: 142972 MGI: 96197 HomoloGene: 19533 GeneCards: HOXC6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding Клітинна компонента • клітинне ядро • nucleoplasm • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system development • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • multicellular organism development • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3223	15425
Ensembl	ENSG00000197757	ENSMUSG00000001661
UniProt	P09630	P10629
RefSeq (мРНК)	NM_153693 NM_004503	NM_010465
RefSeq (білок)	NP_004494 NP_710160	NP_034595
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.99 – 54.03 Mb	Хр. 15: 103 – 103.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXC6 (англ. Homeobox C6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 26 915.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSYFTNPSL		SCHLAGGQDV		LPNVALNSTA		YDPVRHFSTY		GAAVAQNRIY
STPFYSPQEN		VVFSSSRGPY		DYGSNSFYQE		KDMLSNCRQN		TLGHNTQTSI
AQDFSSEQGR		TAPQDQKASI		QIYPWMQRMN		SHSGVGYGAD		RRRGRQIYSR
YQTLELEKEF		HFNRYLTRRR		RIEIANALCL		TERQIKIWFQ		NRRMKWKKES
NLTSTLSGGG		GGATADSLGG		KEEKREETEE		EKQKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Simeone A., Pannese M., Acampora D., D'Esposito M., Boncinelli E. (1988). At least three human homeoboxes on chromosome 12 belong to the same transcription unit.. Nucleic Acids Res. 16: 5379 — 5390.  PubMed DOI:10.1093/nar/16.12.5379
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12