PHF10

PHF10
Ідентифікатори
Символи	PHF10, BAF45A, XAP135, PHD finger protein 10, SMARCG4
Зовнішні ІД	OMIM: 613069 MGI: 1919307 HomoloGene: 10112 GeneCards: PHF10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • histone acetyltransferase activity; • GO:0031493 histone binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • npBAF complex; • histone acetyltransferase complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • histone acetylation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	55274
	72057
	ENSG00000130024
	ENSMUSG00000023883
	Q8WUB8
	Q9D8M7
	NM_133325; NM_018288
	NM_024250; NM_001360983
	NP_060758; NP_579866
	NP_077212; NP_001347912
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PHF10 (англ. PHD finger protein 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 051^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAAGPGAA	LSPRPCDSDP	ATPGAQSPKD	DNEDNSNDGT	QPSKRRRMGS
GDSSRSCETS	SQDLGFSYYP	AENLIEYKWP	PDETGEYYML	QEQVSEYLGV
TSFKRKYPDL	ERRDLSHKEK	LYLRELNVIT	ETQCTLGLTA	LRSDEVIDLM
IKEYPAKHAE	YSVILQEKER	QRITDHYKEY	SQMQQQNTQK	VEASKVPEYI
KKAAKKAAEF	NSNLNRERME	ERRAYFDLQT	HVIQVPQGKY	KVLPTERTKV
SSYPVALIPG	QFQEYYKRYS	PDELRYLPLN	TALYEPPLDP	ELPALDSDGD
SDDGEDGRGD	EKRKNKGTSD	SSSGNVSEGE	SPPDSQEDSF	QGRQKSKDKA
ATPRKDGPKR	SVLSKSVPGY	KPKVIPNAIC	GICLKGKESN	KKGKAESLIH
CSQCENSGHP	SCLDMTMELV	SMIKTYPWQC	MECKTCIICG	QPHHEEEMMF
CDMCDRGYHT	FCVGLGAIPS	GRWICDCCQR	APPTPRKVGR	RGKNSKEG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Banga S.S., Peng L., Dasgupta T., Palejwala V., Ozer H.L. (2009). PHF10 is required for cell proliferation in normal and SV40-immortalized human fibroblast cells. Cytogenet. Genome Res. 126: 227—242. PMID 20068294 DOI:10.1159/000251960
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504