Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TFAP2E
Ідентифікатори
Символи
TFAP2E , AP2E, transcription factor AP-2 epsilon, AP-2epsilon
Зовнішні ІД
OMIM : 614428 MGI: 2679630 HomoloGene: 2422 GeneCards: TFAP2E
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1903374 anatomical structure development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 35.57 – 35.6 Mb
Хр. 4: 126.61 – 126.63 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TFAP2E (англ. Transcription factor AP-2 epsilon ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот , а молекулярна маса — 46 212[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLVHTYSAME RPDGLGAAAG GARLSSLPQA AYGPAPPLCH TPAATAAAEF
QPPYFPPPYP QPPLPYGQAP DAAAAFPHLA GDPYGGLAPL AQPQPPQAAW
AAPRAAARAH EEPPGLLAPP ARALGLDPRR DYATAVPRLL HGLADGAHGL
ADAPLGLPGL AAAPGLEDLQ AMDEPGMSLL DQSVIKKVPI PSKASSLSAL
SLAKDSLVGG ITNPGEVFCS VPGRLSLLSS TSKYKVTVGE VQRRLSPPEC
LNASLLGGVL RRAKSKNGGR CLRERLEKIG LNLPAGRRKA ANVTLLTSLV
EGEAVHLARD FGYVCETEFP AKAAAEYLCR QHADPGELHS RKSMLLAAKQ
ICKEFADLMA QDRSPLGNSR PALILEPGVQ SCLTHFSLIT HGFGGPAICA
ALTAFQNYLL ESLKGLDKMF LSSVGSGHGE TKASEKDAKH RK
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Tummala R., Romano R.-A., Fuchs E., Sinha S. (2003). Molecular cloning and characterization of AP-2 epsilon, a fifth member of the AP-2 family. Gene . 321 : 93—102. PMID 14636996 DOI :10.1016/S0378-1119(03)00840-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші