Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HEY2
Ідентифікатори
Символи
HEY2 , CHF1, GRIDLOCK, GRL, HERP1, HESR2, HRT2, bHLHb32, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2
Зовнішні ІД
OMIM : 604674 MGI: 1341884 HomoloGene: 22705 GeneCards: HEY2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• microsatellite binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • RNA polymerase II activating transcription factor binding • GO:0001948 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• Цитоплазма • transcriptional repressor complex • Sin3 complex • nucleoplasm • клітинне ядро
Біологічний процес
• dorsal aorta morphogenesis • cardiac vascular smooth muscle cell development • cochlea development • pattern specification process • cell fate commitment • pulmonary valve morphogenesis • regulation of auditory receptor cell differentiation • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in smooth muscle cell differentiation • regulation of transcription, DNA-templated • heart trabecula formation • tricuspid valve morphogenesis • regulation of vasculogenesis • pulmonary artery morphogenesis • cardiac septum morphogenesis • negative regulation of cardiac vascular smooth muscle cell differentiation • muscular septum morphogenesis • ventricular septum morphogenesis • protein-DNA complex assembly • cardiac muscle hypertrophy • outflow tract morphogenesis • ascending aorta morphogenesis • cardiac left ventricle morphogenesis • labyrinthine layer blood vessel development • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • coronary vasculature morphogenesis • smooth muscle cell differentiation • negative regulation of gene expression • endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation • transcription, DNA-templated • ventricular trabecula myocardium morphogenesis • positive regulation of heart rate • васкулогенез • multicellular organism development • atrial septum morphogenesis • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • heart development • arterial endothelial cell differentiation • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • blood vessel development • cardiac muscle hypertrophy in response to stress • umbilical cord morphogenesis • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • mesenchymal cell development • artery development • Регуляція експресії генів • negative regulation of transcription by transcription factor localization • negative regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • vascular smooth muscle cell development • anterior/posterior axis specification • tricuspid valve formation • negative regulation of transcription, DNA-templated • cardiac ventricle morphogenesis • cardiac right ventricle morphogenesis • ventricular cardiac muscle cell development • atrioventricular valve development • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • negative regulation of Notch signaling pathway • cardiac epithelial to mesenchymal transition • Notch signaling involved in heart development • Notch signaling pathway • positive regulation of transcription, DNA-templated • Диференціація клітин • regulation of neurogenesis • aortic valve morphogenesis • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • positive regulation of gene expression • negative regulation of biomineral tissue development • anterior/posterior pattern specification • circulatory system development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 125.75 – 125.76 Mb
Хр. 10: 30.83 – 30.84 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
HEY2 (англ. Hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337 амінокислот , а молекулярна маса — 35 808[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKRPCEETTS ESDMDETIDV GSENNYSGQS TSSVIRLNSP TTTSQIMARK
KRRGIIEKRR RDRINNSLSE LRRLVPTAFE KQGSAKLEKA EILQMTVDHL
KMLQATGGKG YFDAHALAMD FMSIGFRECL TEVARYLSSV EGLDSSDPLR
VRLVSHLSTC ATQREAAAMT SSMAHHHHPL HPHHWAAAFH HLPAALLQPN
GLHASESTPC RLSTTSEVPP AHGSALLTAT FAHADSALRM PSTGSVAPCV
PPLSTSLLSL SATVHAAAAA ATAAAHSFPL SFAGAFPMLP PNAAAAVAAA
TAISPPLSVS ATSSPQQTSS GTNNKPYRPW GTEVGAF
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Leimeister C., Externbrinck A., Klamt B., Gessler M. (1999). Hey genes: a novel subfamily of hairy- and enhancer of split related genes specifically expressed during mouse embryogenesis.. Mech. Dev. 85 : 173 — 177. PubMed DOI :10.1016/S0925-4773(99)00080-5
Zhong T.P., Rosenberg M., Mohideen M.-A.P.K., Weinstein B., Fishman M.C. (2000). Gridlock, an HLH gene required for assembly of the aorta in zebrafish.. Science 287 : 1820 — 1824. PubMed DOI :10.1126/science.287.5459.1820
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
Shirvani S., Xiang F., Koibuchi N., Chin M.T. (2006). CHF1/Hey2 suppresses SM-MHC promoter activity through an interaction with GATA-6.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339 : 151 — 156. PubMed DOI :10.1016/j.bbrc.2005.10.190
Reamon-Buettner S.M., Borlak J. (2006). HEY2 mutations in malformed hearts.. Hum. Mutat. 27 : 118 — 118. PubMed DOI :10.1002/humu.9390
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші