ATOH1

ATOH1
Ідентифікатори
Символи	ATOH1, ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, atonal bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601461 MGI: 104654 HomoloGene: 31297 GeneCards: ATOH1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • regulation of neuron differentiation • auditory receptor cell fate determination • диференціація клітин • positive regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of inner ear receptor cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • neuron migration • auditory receptor cell fate specification • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • central nervous system development • brain development • inner ear auditory receptor cell differentiation • inner ear morphogenesis • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • cerebral cortex development • inner ear development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	474	11921
Ensembl	ENSG00000172238	ENSMUSG00000073043
UniProt	Q92858	P48985
RefSeq (мРНК)	NM_005172	NM_007500
RefSeq (білок)	NP_005163	NP_031526
Локус (UCSC)	Хр. 4: 93.83 – 93.83 Mb	Хр. 6: 64.71 – 64.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATOH1 (англ. Atonal bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 38 160.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRLLHAEEW		AEVKELGDHH		RQPQPHHLPQ		PPPPPQPPAT		LQAREHPVYP
PELSLLDSTD		PRAWLAPTLQ		GICTARAAQY		LLHSPELGAS		EAAAPRDEVD
GRGELVRRSS		GGASSSKSPG		PVKVREQLCK		LKGGVVVDEL		GCSRQRAPSS
KQVNGVQKQR		RLAANARERR		RMHGLNHAFD		QLRNVIPSFN		NDKKLSKYET
LQMAQIYINA		LSELLQTPSG		GEQPPPPPAS		CKSDHHHLRT		AASYEGGAGN
ATAAGAQQAS		GGSQRPTPPG		SCRTRFSAPA		SAGGYSVQLD		ALHFSTFEDS
ALTAMMAQKN		LSPSLPGSIL		QPVQEENSKT		SPRSHRSDGE		FSPHSHYSDS
DEAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4