GTF2E1

GTF2E1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1VD4, 2JTX, 2RNQ, 2RNR, 5IY9, 5IYC, 5IYD, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8
Ідентифікатори
Символи	GTF2E1, FE, TF2E1, TFIIE-A, general transcription factor IIE subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 189962 MGI: 1921447 HomoloGene: 38062 GeneCards: GTF2E1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II complex binding • TFIIH-class transcription factor complex binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex • гіалоплазма • transcription preinitiation complex • transcription factor TFIIE complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2960	74197
Ensembl	ENSG00000153767	ENSMUSG00000022828
UniProt	P29083	Q9D0D5
RefSeq (мРНК)	NM_005513	NM_028812 NM_001355727
RefSeq (білок)	NP_005504	NP_083088 NP_001342656
Локус (UCSC)	Хр. 3: 120.74 – 120.78 Mb	Хр. 16: 37.33 – 37.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GTF2E1 (англ. General transcription factor IIE subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 452.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADPDVLTEV		PAALKRLAKY		VIRGFYGIEH		ALALDILIRN		SCVKEEDMLE
LLKFDRKQLR		SVLNNLKGDK		FIKCRMRVET		AADGKTTRHN		YYFINYRTLV
NVVKYKLDHM		RRRIETDERD		STNRASFKCP		VCSSTFTDLE		ANQLFDPMTG
TFRCTFCHTE		VEEDESAMPK		KDARTLLARF		NEQIEPIYAL		LRETEDVNLA
YEILEPEPTE		IPALKQSKDH		AATTAGAASL		AGGHHREAWA		TKGPSYEDLY
TQNVVINMDD		QEDLHRASLE		GKSAKERPIW		LRESTVQGAY		GSEDMKEGGI
DMDAFQEREE		GHAGPDDNEE		VMRALLIHEK		KTSSAMAGSV		GAAAPVTAAN
GSDSESETSE		SDDDSPPRPA		AVAVHKREED		EEEDDEFEEV		ADDPIVMVAG
RPFSYSEVSQ		RPELVAQMTP		EEKEAYIAMG		QRMFEDLFE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Див. також

• Хромосома 3