Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TP63
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
4A9Z , 1RG6 , 2RMN , 2Y9T , 2Y9U , 3QYM , 3QYN , 3US0 , 3US1 , 3US2 , 3ZY0 , 3ZY1
Ідентифікатори
Символи
TP63 , AIS, B(p51A), B(p51B), EEC3, KET, LMS, NBP, OFC8, RHS, SHFM4, TP53CP, TP53L, TP73L, p40, p51, p53CP, p63, p73H, p73L, tumor protein p63
Зовнішні ІД
OMIM : 603273 MGI: 1330810 HomoloGene: 31189 GeneCards: TP63
Пов'язані генетичні захворювання
adenocarcinoma of the lung , lymphoblastic leukemia , рак легень , ADULT syndrome , Limb–mammary syndrome [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • damaged DNA binding • GO:0001948 protein binding • WW domain binding • double-stranded DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • identical protein binding • chromatin binding • p53 binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • MDM2/MDM4 family protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein domain specific binding
Клітинна компонента
• Цитоплазма • neuron projection • клітинне ядро • rough endoplasmic reticulum • nuclear chromatin • transcription regulator complex • nucleoplasm • Дендрит (нейробіологія) • мітохондрія • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • macromolecular complex
Біологічний процес
• pattern specification process • skeletal system development • epithelial cell development • negative regulation of keratinocyte differentiation • epidermal cell division • anatomical structure formation involved in morphogenesis • prostate gland development • transcription from RNA polymerase II promoter • squamous basal epithelial stem cell differentiation involved in prostate gland acinus development • ectoderm and mesoderm interaction • cellular response to DNA damage stimulus • female genitalia morphogenesis • odontogenesis of dentin-containing tooth • prostatic bud formation • cell aging • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • Сперматогенез • multicellular organism aging • smooth muscle tissue development • positive regulation of fibroblast apoptotic process • animal organ morphogenesis • hair follicle morphogenesis • positive regulation of Notch signaling pathway • Апоптоз • Ремоделювання хроматину • regulation of transcription, DNA-templated • regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of apoptotic signaling pathway • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • transcription, DNA-templated • embryonic limb morphogenesis • negative regulation of mesoderm development • epidermis development • post-anal tail morphogenesis • response to gamma radiation • protein homotetramerization • Notch signaling pathway • hair follicle development • neuron apoptotic process • polarized epithelial cell differentiation • proximal/distal pattern formation • Диференціація клітин • positive regulation of keratinocyte proliferation • skin morphogenesis • epithelial cell differentiation • urinary bladder development • cellular response to UV • establishment of planar polarity • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • protein tetramerization • keratinocyte proliferation • positive regulation of osteoblast differentiation • regulation of epidermal cell division • negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cellular senescence • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • sympathetic nervous system development • establishment of skin barrier • morphogenesis of a polarized epithelium • keratinocyte differentiation • multicellular organism development • mitotic G1 DNA damage checkpoint • cloacal septation • response to X-ray • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of apoptotic process • Старіння людини • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of somatic stem cell population maintenance • проліферація • epidermal cell differentiation • embryonic forelimb morphogenesis • embryonic hindlimb morphogenesis • skin epidermis development • cranial skeletal system development • developmental process
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 189.63 – 189.9 Mb
Хр. 16: 25.68 – 25.89 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
TP63 (англ. Tumor protein p63 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 680 амінокислот , а молекулярна маса — 76 785[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNFETSRCAT LQYCPDPYIQ RFVETPAHFS WKESYYRSTM SQSTQTNEFL
SPEVFQHIWD FLEQPICSVQ PIDLNFVDEP SEDGATNKIE ISMDCIRMQD
SDLSDPMWPQ YTNLGLLNSM DQQIQNGSSS TSPYNTDHAQ NSVTAPSPYA
QPSSTFDALS PSPAIPSNTD YPGPHSFDVS FQQSSTAKSA TWTYSTELKK
LYCQIAKTCP IQIKVMTPPP QGAVIRAMPV YKKAEHVTEV VKRCPNHELS
REFNEGQIAP PSHLIRVEGN SHAQYVEDPI TGRQSVLVPY EPPQVGTEFT
TVLYNFMCNS SCVGGMNRRP ILIIVTLETR DGQVLGRRCF EARICACPGR
DRKADEDSIR KQQVSDSTKN GDGTKRPFRQ NTHGIQMTSI KKRRSPDDEL
LYLPVRGRET YEMLLKIKES LELMQYLPQH TIETYRQQQQ QQHQHLLQKQ
TSIQSPSSYG NSSPPLNKMN SMNKLPSVSQ LINPQQRNAL TPTTIPDGMG
ANIPMMGTHM PMAGDMNGLS PTQALPPPLS MPSTSHCTPP PPYPTDCSIV
SFLARLGCSS CLDYFTTQGL TTIYQIEHYS MDDLASLKIP EQFRHAIWKG
ILDHRQLHEF SSPSHLLRTP SSASTVSVGS SETRGERVID AVRFTLRQTI
SFPPRDEWND FNFDMDARRN KQQRIKEEGE
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз , транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Augustin M., Bamberger C., Paul D., Schmale H. (1998). Cloning and chromosomal mapping of the human p53-related KET gene to chromosome 3q27 and its murine homolog Ket to mouse chromosome 16.. Mamm. Genome 9 : 899 — 902. PubMed DOI :10.1007/s003359900891
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
Kim E.-J., Park J.-S., Um S.-J. (2002). Identification and characterization of HIPK2 interacting with p73 and modulating functions of the p53 family in vivo.. J. Biol. Chem. 277 : 32020 — 32028. PubMed DOI :10.1074/jbc.M200153200
Zeng S.X., Dai M.-S., Keller D.M., Lu H. (2002). SSRP1 functions as a co-activator of the transcriptional activator p63.. EMBO J. 21 : 5487 — 5497. PubMed DOI :10.1093/emboj/cdf540
Li Y., Zhou Z., Chen C. (2008). WW domain-containing E3 ubiquitin protein ligase 1 targets p63 transcription factor for ubiquitin-mediated proteasomal degradation and regulates apoptosis.. Cell Death Differ. 15 : 1941 — 1951. PubMed DOI :10.1038/cdd.2008.134
Zheng M.Z., Zheng L.M., Zeng Y.X. (2008). SCC-112 gene is involved in tumor progression and promotes the cell proliferation in G2/M phase.. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 134 : 453 — 462. PubMed DOI :10.1007/s00432-007-0306-x
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші