TAF6

TAF6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF6, MGC:8964, TAF(II)70, TAF(II)80, TAF2E, TAFII-70, TAFII-80, TAFII70, TAFII80, TAFII85, TATA-box binding protein associated factor 6, ALYUS
Зовнішні ІД	OMIM: 602955 MGI: 109129 HomoloGene: 7561 GeneCards: TAF6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • aryl hydrocarbon receptor binding Клітинна компонента • MLL1 complex • transcription factor TFTC complex • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • SAGA complex • transcription factor TFIID complex • SLIK (SAGA-like) complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • negative regulation of cell cycle • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription by RNA polymerase II • regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • negative regulation of cell population proliferation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6878	21343
Ensembl	ENSG00000106290	ENSMUSG00000036980
UniProt	P49848	Q62311
RefSeq (мРНК)	NM_001190415 NM_005641 NM_139122 NM_139123 NM_139315 NM_001364998 NM_001364999 NM_001365000 NM_001365001 NM_001365002 NM_001365003 NM_001365004	NM_009315 NM_001356600 NM_001356601 NM_001356602
RefSeq (білок)	NP_001177344 NP_005632 NP_647476 NP_001351927 NP_001351928 NP_001351929 NP_001351930 NP_001351931 NP_001351932 NP_001351933	NP_033341 NP_001343529 NP_001343530 NP_001343531
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.11 – 100.12 Mb	Хр. 5: 138.18 – 138.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF6 (англ. TATA-box binding protein associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 72 668.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEEKKLKLS		NTVLPSESMK		VVAESMGIAQ		IQEETCQLLT		DEVSYRIKEI
AQDALKFMHM		GKRQKLTTSD		IDYALKLKNV		EPLYGFHAQE		FIPFRFASGG
GRELYFYEEK		EVDLSDIINT		PLPRVPLDVC		LKAHWLSIEG		CQPAIPENPP
PAPKEQQKAE		ATEPLKSAKP		GQEEDGPLKG		KGQGATTADG		KGKEKKAPPL
LEGAPLRLKP		RSIHELSVEQ		QLYYKEITEA		CVGSCEAKRA		EALQSIATDP
GLYQMLPRFS		TFISEGVRVN		VVQNNLALLI		YLMRMVKALM		DNPTLYLEKY
VHELIPAVMT		CIVSRQLCLR		PDVDNHWALR		DFAARLVAQI		CKHFSTTTNN
IQSRITKTFT		KSWVDEKTPW		TTRYGSIAGL		AELGHDVIKT		LILPRLQQEG
ERIRSVLDGP		VLSNIDRIGA		DHVQSLLLKH		CAPVLAKLRP		PPDNQDAYRA
EFGSLGPLLC		SQVVKARAQA		ALQAQQVNRT		TLTITQPRPT		LTLSQAPQPG
PRTPGLLKVP		GSIALPVQTL		VSARAAAPPQ		PSPPPTKFIV		MSSSSSAPST
QQVLSLSTSA		PGSGSTTTSP		VTTTVPSVQP		IVKLVSTATT		APPSTAPSGP
GSVQKYIVVS		LPPTGEGKGG		PTSHPSPVPP		PASSPSPLSG		SALCGGKQEA
GDSPPPAPGT		PKANGSQPNS		GSPQPAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 DOI:10.1002/pmic.200390030
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Weinzierl R.O., Ruppert S., Dynlacht B.D., Tanese N., Tjian R. (1993). Cloning and expression of Drosophila TAFII60 and human TAFII70 reveal conserved interactions with other subunits of TFIID. EMBO J. 12: 5303—5309. PMID 8262073

Див. також

• Хромосома 7